【摘 要】
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目的:建立在普通高效液相色谱仪上检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)的具有普遍意义的TmHPLC技术;建立一种新的寻找基因SNPs的技术策略,并用此技术策
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目的:建立在普通高效液相色谱仪上检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)的具有普遍意义的TmHPLC技术;建立一种新的寻找基因SNPs的技术策略,并用此技术策略探索HLA-F、HFE和MIC-B基因的SNPs.结论:温度调控高效液相色谱法是一种高效、灵敏、操作简便且具有普遍适用意义的扫描基因组SNPs技术,检出率可达80﹪以上.2.用温度调控高效液相色谱发现DNA序列变异,测序明确变异部位和性质,PCR-RFLP或PCR-SSP检测SNPs在人群中基因型分布的技术路线,是一种高通量的探索基因组SNPs的策略.3.该研究用该技术策略扫描人群样本发现4个HLA区SNPs,其中HFE4586、4919和5431 SNPs是该次研究新发现的;MIC-B 8034 SNP是在我们之前,由国外学者发现并报道的.在这4个SNPs中,HFE 4919 SNP可能有功能意义.4.用生物信息学的手段研究HFE 4919 SNP的功能意义,选用的软件不能预测出HFE 4919 SNP和COL17A1 R795X变异对表达模式的影响,提示现有软件存在设计缺陷.目前尚不能排除HFE 4919 SNP引起表达模式改变的可能性.通过生物信息学方法分析,我们发现HFE基因所在的DNA区段上可能存在不止一个结构基因,为HFE基因的功能研究提出了新思路.
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