成人费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病TKI耐药分子特征及早期诊断研究

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jeffbee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]1.探讨本中心成人费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病(Ph+ALL)的初诊临床特征、治疗疗效和预后;对复发或难治Ph+ALL患者TKI耐药的患者进行临床特征、分子生物学特征、疗效预后分析。2.探讨ABL激酶区突变谱,突变对疗效和预后的影响。分析抗CD19CAR-T和异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)治疗对TKI耐药后复发或难治Ph+ALL伴T315I突变患者的预后改善情况。3.构建基于TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR(Real-time fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)和微滴数字PCR(Droplet Digital PCR,dd-PCR)检测ABL激酶区T315I突变的新方法。探索两种方法在Ph+ALL复发患者中T315I基因突变检测和早期诊断的价值,指导临床个体化治疗。[方法]1.本研究系统性收集2011.01~2021.06期间本中心收治的405例Ph+ALL相关资料,包括临床信息、细胞遗传学、分子生物学、治疗方式以及患者随访资料等。分析TKI 一线治疗Ph+ALL患者的临床和实验室特征,回顾性分析TKI耐药Ph+ALL患者临床和生物学特征,分析三代TKIs、allo-HSCT对治疗疗效和生存的影响。2.回顾性分析159例Ph+ALL患者ABL激酶区突变的临床特征及突变对预后的影响。对比T315I突变和非突变患者的临床特征差别。中心早期采用sanger法检测ABL激酶区突变;后期应用二代测序技术(NGS)测序平台对ABL激酶区相关的基因突变进行目标区域PCR富集和高通量测序。3.收集ABL激酶T区315I突变Ph+ALL患者(经基因测序证实存在T315I点突变)和健康人的骨髓标本,合成T315I突变质粒。针对ABL激酶区T315I突变区域设计PCR扩增引物,将扩增产物构建到pGEM-T质粒载体并进行细菌转化;将挑取的克隆菌落在含氨苄青霉素的LB培养液中增殖大量转化质粒;提取T315I突变的质粒和T315野生型质粒,把构建的质粒和菌落送到苏州金唯智公司测序,借助新方法验证质粒和菌落的DNA情况;选择T315I点突变的质粒和T315I非突变型质粒通过大肠杆菌大量培养以生产质粒留用。用慢病毒包装系统构建T315I突变体表达的白血病细胞株(Sup-B15)。基于TaqMan-MGB探针设计RT-qPCR方法和dd-PCR方法检测T315I突变,优化引物浓度、解链温度、探针浓度,构建最佳反应体系,评估两种方法的敏感度、特异度、准确度。评估2种方法对T315I突变的检测效能和早期诊断[结果]1.初诊374例Ph+ALL患者资料相对完整,其中女性177例(47.3%)、男性197例(52.7%),初诊时中位年龄39.5(14~78)岁,中位白细胞计数(WBC)39.5(1.0~650×109/L,中位血红蛋白(HGB)95(21~174)g/L,中位血小板计数(Plt)34(1~533)g/L。伴有附加染色体异常患者142例(38%)。1~2个诱导疗程的首次CR率92.9%,5年中位OS 58.4个月。二代TKI(达沙替尼、尼洛替尼)的疗效优于伊马替尼,复发率显著低于伊马替尼,均有统计学差异。诱导治疗后接受异基因移植的患者生存改善很明显,2年EFS、OS分别是61.3%和73.9%。初诊患者单因素分析中年龄、TKIs、CR、MMR具有统计学差异。多因素分析中MMR、allo-HSCT显示较好的改善预后作用。159例TKI耐药的患者从缓解到血液学复发,中位时间19月(4.8~109月),从分子学复发到血液学复发约4.5月(0.6~30月),他们初诊时年龄、白细胞较未耐药组高,有统计学差异(分别为p=0.001、P=0.026);血液学反应和分子生物学反应低于未耐药组,具有统计学意义。二线TKI治疗复发患者,共有136例可评估,CR2 106例(77.9%),再次CR率在没用TKI的患者是8例(32%),伊马替尼患者12例(81.8%),达沙替尼患者63例(89.4%),尼洛替尼患者35例(87.5%),普纳替尼患者19例(T315I突变)(90.5%)。61(58%)例获得MRD阴性。53(50%)例获得MMR,28(26%)例获得CMR。非TKI组、伊马替尼组、达沙替尼组、尼洛替尼组、普纳替尼组中位OS分别为6月、14.6月、22月、22.7月、30月(P<0.05);复发患者移植后的中位OS为26月,非移植患者仅为14月,(P=0.002);单倍体移植对比全相合移植中位OS为21月、26月,(P=0.34)。2.159例TKI耐药患者有118(74%)例ABL激酶区突变,共24种类型突变,其中T315I突变最常见,占突变患者55.1%(65/118),然后是E255K/V36.4%(43/118)和Y253H/F 16.1%(19/118)。ABL激酶区突变患者和非突变患者中位OS分别为23.5个月和未达到,统计学差异明显。5年生存率未突变组和突变组分别为63%和16%(P<0.001),突变患者和非突变患者中位EFS分别为6.6个月和未达到。回顾性分析ABL激酶区T315I非突变型309例,T315I突变型65例。针对MMR,T315I非突变99例,突变组10例(P=0.008),TKI使用率和种类在两组中无明显差异,T315I非突变组患者CHR与突变组患者类似(92.3%vs90.8%),分子生物学深度的缓解率为(34.5%vs16.9%),(p=0.008),T315I非突变和突变的两组患者在OS、EFS上均存在显著差异。抗CD19 CAR-T治疗27例成人复发Ph+ALL伴有T315I基因突变患者,其中同胞全相合移植6例(22%),单倍体HSCT16例(59%);24(88%)例达到CR,其中MRD阴性率70%(17/24),中位RFS 20.5月(1-55月),截至2021年12月31,中位OS 39月(8-76月),5年生存率32%。其中12例CAR-T后桥接异基因HSCT,预后得到明显延长。CAR-T 细胞输注后无 CRS(cytokine release syndrome)9 例(33%),轻中度 CRS有15例(55.6%);2例(病例16、20)出现3级CRS,病例20同时合并HLH,病例3死于4级CRS。所有病例未出现CAR-T所致脑病综合征(CRES)。3.成功合成BCR-ABL融合基因激酶区T315I突变型质粒和野生型的质粒,成功构建基于TaqMan-MGB RT-qPCR和dd-PCR对ABL激酶区T315I突变的两种检测方法。TaqMan-MGB RT-qPCR体系得到最大优化,RT-qPCR方法的分析灵敏度约为10拷贝/ul;梯度稀释质粒后,dd-PCR对T315I突变质粒的检测敏感度为10~1拷贝/ul。回顾发现经既往Sanger测序法检测到6例T315I基因突变,而经本实验新建的dd-PCR方法多检测到2例T315I基因突变患者,其中1例初诊患者在TKI治疗后第3月就检测到T315I基因突变。利用Sanger法检测到的6例突变中,dd-PCR提前检测到3例T315I基因突变,分别提前了8个月、10个月、14个月,并检测到3例微突变,介于1-10copies/ul。2例患者提前给予普纳替尼、anti-CD19 CAR-T、异基因HSCT治疗,病情再次获得CR,中位生存期超44月,治疗反应和预后得到改善。新建的RT-qPCR方法能额外发现一例T315I突变,未能检测出dd-PCR检测到的3例微量突变。[结论]1、普纳替尼能改善Ph+ALL伴T315I突变患者疗效、预后。积极接受allo-HSCT可以显著改善成人复发Ph+ALL患者的预后,单倍体造血干细胞移植和全相合造血干细胞移植疗效相当,该优势突破既往无供体移植瓶颈。研究发现Ph+ALL治疗后复发、预后不良与TKI耐药存在密切关系。2.成人Ph+ALL患者发生TKI耐药大部分为ABL激酶区突变,最常见为T315I突变,其次为E255K/V,Y253H/F。相对于T315I非突变的Ph+ALL,T315I突变患者具有高白细胞,分子反应更低,预后更差的特点。Anti CD19 CAR-T治疗Ph+ALL复发后伴T315I突变患者,疗效可靠,不良反应可控,桥接异基因HSCT能改善患者长期预后。3.本研究成功构建RT-qPCR和dd-PCR检测ABL激酶区T315I突变的新方法体系。dd-PCR方法绝对定量检测T315I突变水平,敏感性优于RT-qPCR。Dd-PCR可实现对Ph+ALL复发患者T315I突变的早期检测和精准诊断。临床上体现较好的检测能力。依据dd-PCR高敏检测结果,指导临床用药以及个体化治疗,可以改善患者预后。需要进一步扩大临床样本来验证其全面的应用价值以及推广使用。
其他文献
目的:先天性巨结肠(Hirschsprung’s disease,HSCR)是一种由于胚胎发育早期肠神经系统功能异常,进而导致的先天性消化道疾病。发病机制中,神经嵴细胞的迁移异常在HSCR的发病机制中起着重要的作用。先天性巨结肠症的临床表现有多重症状,包括长期便秘,间断呕吐,反复腹胀和生长发育迟缓等。未经治疗的疾病通常会影响患儿生长发育,甚至死亡,目前的治疗方法以手术为主,切除病变肠管,重建肠道完
学位
在航空航天、军工、冶金、船舶等领域,一些大型或超大型零部件不可避免地在工作中会出现损伤,其高剩余附加值属性对零件的快速原位修复有着巨大的市场需求。对于不便拆卸或移动以及空间结构复杂零部件的修复,现有激光熔覆技术尚无法满足需求。本文提出激光内送粉空间多方位熔覆技术,使被修复零件保持不动,而激光熔覆喷头进行空间大范围角度运动,以实现大型零件的原位修复。本文主要研究内容、方法及结论如下:(1)基于激光内
学位
基于介电湿润驱动机制的数字微流控技术作为一种新兴的能够处理皮升到微升级别液体的微流控技术,以其独特的优势吸引了众多研究者的关注,广泛应用于生化分析等领域。该技术通过外加电压操控液滴以完成液滴分配、输运、合并、混合以及分裂等多种基本操作,具有样品或试剂消耗小,试样反应分析时间少、易于对液滴实现自动化操控以及精确的定量控制等优点。但传统的芯片微加工技术成本高昂,制备工艺复杂耗时,让众多普通大众用户望而
学位
针对室内扫地机器人的路径优化问题,本文从目标检测以及自主探索两方面展开研究。在目标检测方面,论文提出了一种基于逆残差的轻量化模型,并在面向扫地机器人的基准数据集上验证后进行了芯片移植。在自主探索方面,以房间语义信息为引导,基于闭合定律提出了一种融合目标识别的路径优化方法。综上所述,本文围绕基准数据集的建立、目标检测网络轻量化以及自主探索等方面展开研究,主要研究内容概括如下:第一,针对现有目标检测模
学位
背景与目的:肺癌是全世界癌症致死率高的的最常见肿瘤,尽管近年来临床治疗技术取得了一定的进步,患者预后仍未能获得显著改善,5年生存率仍很低。同时,肺癌的发生发展也是世界范围内的一个重大公共卫生问题,吸烟是肺癌发生发展的第一大诱因。本课题组前期的研究结果表明长期香烟烟雾暴露能够诱导人永生化支气管上皮细胞BEAS-2B发生恶性转化,表现为细胞增殖和迁移能力的增强以及细胞的凋亡逃逸,裸鼠皮下成瘤实验也证实
学位
新生儿期是大脑发育关键又敏感的时期。新生儿期良好的脑认知状态为毕生发展打下了坚实基础。听觉的发育较早,使得新生儿听觉感知表现突出,出生后即可辨识胎儿期接触的声音、包括母亲声音,并可对声音刺激不同频率响度及不同情绪等具有敏感识别能力。然而新生儿脑认知处于逐步发育完善进程中,功能表达不典型,存在复杂、不稳定、不成熟等特点,其影响因素众多,正常新生儿认知发育特征如何,如何去评价,尚不清楚。出生后的环境因
学位
相关背景:新生儿坏死性小肠结肠炎(necrotizing enterocolitis,NEC)是一种好发于早产儿的严重消化系统疾病。截止目前,人们对NEC的发生机理仍不十分了解,但认为许多因素参与其中。目前的临床研究已发现:早产、缺血缺氧、人工喂养、喂养不当、感染、肠道微生物菌群异位定植等,为NEC发病的主要高危因素。由于NEC发病机制不明,部分患儿起病隐匿,且缺乏较为有效的预防手段。目前的治疗主
学位
背景:胆总管囊肿(Choledochal Cyst,CC)是一种常见的先天性胆道系统畸形,主要表现为胆总管囊状或梭形扩张。该病好发于亚洲人群,其中日本为该病高发地区,且主要出现在儿童中。该病具体发病原因不明,目前认为可能是胆胰管汇合处畸形,引起胰液回流至胆道系统中,进而导致胆道系统发生扩张。经体表超声(Ultrasonography,US)和多模态成像技术是CC的常规诊断方式,然而,遇到一些不典型
学位
糖尿病是一种以高血糖为特征的代谢性疾病,通常由胰岛素产生不足或对胰岛素的无效应答引起,是世界范围内的主要健康问题。糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是糖尿病最常见的慢性并发症之一,是终末期肾病(End stage renal disease,ESRD)的主要原因。随着生活水平的提高,DN的患病率和发病率也呈现一个快速增长的趋势,严重降低了人们的生活质量,同时也给社会经济造
学位
研究背景:肺癌是一种多病因的疾病,在众多的致病因素中,放射性氡及其子体被认为是继吸烟之后导致肺癌的第二位危险因素,也是不吸烟者中的第一位危险因素。氡(Radon,Rn)是一种无色无味的放射性气体,已被国际癌症组织和美国环境保护局定为人类致癌物。长期的氡暴露还可增加不吸烟者的肺癌发生率,这通常与TP53基因的突变有关。肿瘤抑制基因TP53的变异能够通过不同的方式促进人类癌症的发生与发展,在几乎所有类
学位