BaMV新寄主的发现及其分离物基因组测定

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zohan_rfs
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竹花叶病毒(Bamboo mosaic virus,BaMV)在自然条件下主要侵染竹类植物,是马铃薯X病毒属(Potexviurs)重要的成员,也是该属唯一携带卫星RNA(satRNA)的病毒。BaMV侵染竹类植物后,造成叶片呈现花叶,竹笋木质化和发笋率降低等,影响竹子的正常生长和产量。目前,竹类主要繁殖方式是通过无性繁殖方式进行,很容易造成病毒扩散,无法根治。该病毒曾对台湾的竹产业形成了严重的危害。所以深入了解竹花叶病毒的寄主范围和遗传进化情况有利于病毒检疫和防控。第二代测序技术(Next Generation sequencing,NGS)突破了传统的病毒鉴定的局限性,对检测植物是否携带已知或未知病毒,即使病毒含量低也是一个很好的方法。本研究通过转录组深度测序技术鉴定了竹林下的金线莲携带了竹花叶病毒,并利用分子生物学和血清学的检测方法对竹林下的其它非竹类植物进行检测,目的是摸清竹花叶病毒的寄主范围及非竹类植物的病毒分离物遗传多样性和进化关系,取得的实验结果如下:(1)利用深度测序法对采自竹林下的金线莲(Anoectochilus roxburghii)进行转录组测序,通过对测序数据的拼接和比对鉴定了金线莲携带竹花叶病毒。通过RT-PCR技术和血清学技术验证了金线莲是竹花叶病毒寄主之一。(2)初步确定BaMV寄主范围。从福建农林大学百竹园的竹林下采集30个非竹类植物样品,其中9种非竹类植物中检测到了竹花叶病毒。最后利用分段测序从弓果黍(Cyrtococcum patens)、蒺藜草(Cenchrus echinatus)、中华薹草(Carex chinensis)、构树(Broussonetia papyrifera)和金线莲(Anoectochilus roxburghii)5种非竹类植物中得到BaMV全基因组和卫星RNA,这些植物都是世界范围内首次发现的BaMV新寄主。(3)BaMV遗传进化分析表明:BaMV的遗传变异与不同寄主无明显关系,与采集地区有一定关系。
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