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本研究分别用pCC1BAC/EcoRI和pCC1BAC/HindIII载体首次构建了两个草鱼(Ctenopharyngodonidella)基因组细菌人工染色体(BAC)文库。EcoRI文库含有53000个克隆。随机挑取150个BAC克隆NotI酶酶切结果表明:插入片段为20kb~265kb,平均插入片段长度为139.7kb,空载率为2%,插入片段大于100kb的克隆所占的比率为84%。草鱼单倍体基因组的大小约为1000Mb,因此本文库的覆盖率达到草鱼基因组的7.4倍。从该文库中找到任意单拷贝基因序列的概率为99.94%。HindIII文库含有52216个克隆,空载率2.8%,插入片段平均长度为121.5kb。覆盖率达到草鱼基因组的6.3倍。以4×2的阵式将所有文库克隆制成高密度尼龙膜。每张尼龙膜分别对应于4个384孔板。该文库可用于草鱼重要经济性状基因克隆、分子标记开发、物理图谱构建、比较基因组研究和全基因组测序奠定基础,并将为草鱼和其它鲤科养殖鱼类的遗传改良提供理论依据和技术支撑。