长江三角洲白山羊是我国著名的笔料毛型山羊品种,其所产的优质三类毛是制高档毛笔的独特原料。由于地方良种资源的保护重视程度不够,国外山羊品种导入率不断升高以及笔料毛山羊的管理方式、饲养条件的参差不齐,导致了目前优质笔料毛生产逐渐萎缩,优质笔料毛种质资源的保护工作陷入了困难的境地,形势较为严峻。目前,对长江三角洲白山羊优质笔料毛性状的研究主要是集中在宏观领域,而从分子水平阐明优质笔料毛生成的机理,在国内外的研究中尚未见过相关的报道。因此,本研究重点从分子水平上对长江三角洲白山羊优质笔料毛性状形成的机理进行研究,以达到保护和利用好长江三角洲白山羊这一珍贵遗传资源的目的,为今后分子选种和育种奠定基础,具有非常重要的意义。本试验旨在筛选长江三角洲白山羊皮肤中笔料毛性状差异表达的基因,研究和探讨差异表达的基因对优质笔料毛生成的影响和作用。利用mRNA差异显示技术,比较优质笔料毛个体颈脊部与腹侧部的皮肤组织,以及比较优质笔料毛个体与非笔料毛型个体颈脊部皮肤组织中基因的差异表达,通过反向Northern点杂交去除假阳性条带,经克隆、测序后,得到的序列在NCBI数据库中进行Blastn检索,与已知序列进行同源性比较,并预测其功能。研究结果显示：(1)通过mRNA差异显示共筛选出20条差异条带,其大小在150-500bp之间,经反向Northern点杂交验证,获得6个阳性的差异表达片段；(2)差异片段克隆、测序后在NCBI数据库中与已知序列进行同源性比较,发现3个差异片段与已知功能基因相似,分别为趋化素样因子3(CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing3, CMTM3)、富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白／骨粘连蛋白(secreted protein, acidic, cysteine-rich/osteonectin, SPRAC)和钙结合蛋白S100A4(S100calcium binding protein A4, S100A4);其他3个片段与已知序列相似但功能未知。分析结果表明：(1)CMTM3基因过量表达可抑制雄性激素受体(androgen receptor,AR)的转录活性,可能会通过抑制AR转录活性的方式间接调控优质笔料毛的形成；(2)SPARC基因参与了多个信号转导通路并调节多种生长因子,如Wnt、FGF、TGF-β、IGF-1、血小板衍化生长因子(PDGF)等,可能通过这些信号通路和细胞因子影响毛发的结构和形状的形成,对长江三角洲白山羊优质笔料毛的形成产生一定的作用；(3)钙结合蛋白S100A4基因与其他表皮分化相关基因共同定位于染色体1q21上(该区域为表皮分化复合体),与皮肤分化、毛囊及皮肤腺体的成熟密切相关并参与毛发生长和周期循环。(4)三个功能未知的序列是毛发生长与毛发循环分子调控机制研究中的新发现,其功能需要进一步验证。这些已知基因和未知片段对长江三角洲白山羊优质笔料毛的形成所起的作用还需要进一步的研究,其调控机制还未完全阐明。本研究筛选出6个差异片段可以为今后进一步研究长江三角洲白山羊优质笔料毛形成的分子机制以及毛发生长和毛囊周期的调控机制提供实验依据和理论基础。