SLA-DQB和DRB基因外显子2的PCR-RFLP分析及一个新SLA-DQB等位基因的发现

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采用PCR-RFLP法对中国地方猪种五指山、二花脸及国外猪种皮特兰猪的SLA-DQB和DRB基因外显子2的PCR产物进行了分析。SLA-DQB基因外显子2经限制酶HaeⅢ(7种RFLP带型)和Rsal(6种RFLP带型)酶切后共分出9种RFLP带型,五指山、二花脸和皮特兰猪分别分出3、3、5种RFLP带型;SLA-DRB基因外显子2经限制酶MspⅠ(1种RFLP带型)和RsaⅠ(5种RFLP带型)酶切后共分出5种RFLP带型,五指山、二花脸和皮特兰猪分别分出2、3、3种RFLP带型。 通过RFLP带型分析后,将带型为AA的五指山猪的SLA-DQB基因外显子2的PCR产物进行克隆测序,结果发现了一个新的等位基因SLA-DQB*NAU。DNA序列已经提交美国国家生物信息技术中心(NCBI),登录号为AY281361。这一新SLA-DQB等位基因在抗原肽结合槽处发生了一个氨基酸突变。 将组合RFLP带型BCFGHHIJ标记为a带型,组合RFLP带型CCFFHHII标记为b带型。对a、b两种带型的二花脸猪进行血清IgG含量、淋巴细胞转化率和PHA皮肤试验等抗病力指标的检测,来分析不同RFLP带型猪之间差异。结果表明:基因型为杂合子(a带型)的猪比纯合子(b带型)的猪在对抗疾病的免疫能力上有一定的差异,杂合子更具优势。
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