目前,中国节能减排行动已取得显著成效。但是鉴于“30·60”目标的临近,进一步实行节能减排政策迫在眉睫。城市群的兴起已成为中国实施区域发展战略、加速城镇化进程中催生出的经济集聚效应的基本表现。粤港澳大湾区和长三角城市群是中国经济规模较大和经济密度较高的区域,但是同时也是能源消费规模较大、环境污染问题较为突出的地区。因此,对于粤港澳大湾区与长三角城市群碳排放效率的研究对其碳中和路径的探索以及低碳经济的整体发展具有重要的参考意义。本文基于2005-2019年面板数据,利用非期望产出超效率SBM模型对粤港澳大湾区与长三角城市群碳排放效率进行对比分析。之后,利用情景分析方法预测2021-2030年两大城市群的碳排放效率。为探究两大区域碳排放效率影响因素,本文通过构建空间误差模型和空间杜宾模型分析经济发展、产业结构、能源强度、能源结构、社会因素、生态环境、对外开放和政府干预等因素对两大城市群碳排放效率的影响。研究结果发现:2005-2019年粤港澳大湾区碳排放效率均值呈现“上升—下降”的趋势,香港、深圳和澳门由于较高的经济发展水平和较为发达的服务业碳排放效率居于领先地位,而肇庆和惠州由于处于边缘区域、产业结构有待改善等原因,碳排放处于相对低效率水平。2005-2019年长三角城市群碳排放效率均值在0.6以下,且呈现下降趋势,金华、苏州和无锡均值较大,池州历年均值最小。粤港澳与长三角碳排放效率具有以下相似之处:第一,碳排放效率均值呈现下降趋势;第二,城市群内部各市碳排放效率具有差异。具有以下不同之处:第一,粤港澳大湾区碳排放效率均值一直高于长三角城市群;第二,粤港澳大湾区内部各市碳排放效率差异较大,而长三角各市碳排放效率值较为均匀。进一步探究碳排放效率影响因素,可以发现经济发展和政府干预对于粤港澳大湾区和长三角城市群碳排放效率的增加分别具有正向和负向影响。能源强度以及生态环境保护会损害粤港澳大湾区碳排放效率的提高;产业结构不合理和对外开放程度提高不利于长三角城市群碳排放效率的改善。