课程设置是培养硕士生掌握坚实的基础理论和系统的专门知识的前提。本文主要探讨了基于创新教育理念的工科硕士生课程设置。全文主体分为四个部分。具体阐述了创新教育的内涵(包括创新人格的塑造、创新意识的培养、创新思维的训练和创新实践能力的培养)、创新教育的立论基础(理论基础和现实基础)和创新教育的特性(超越性、整体性、主体性和实效性)。从课程目标、课程内容、课程结构三方面阐述了基于创新教育的硕士生课程设置要素。进而探讨了基于创新教育的硕士生课程设置原则：相关性与集中性相结合、科学性与人文性相统一、灵活性、交流性、注重实际性。对国内十余所高校材料科学与工程学科硕士研究生的课程设置进行了分析，得出现行硕士生课程设置不符合创新教育的要求，不利于创新人才的培养，主要体现在：公共课学时比例较大、学位课设置差异较大、课程设置结构不太合理等。分析其原因主要是受传统教育观念、传统培养模式和学科发展水平等三方面的影响。在前几部分的基础上，提出基于创新教育理念的硕士生课程设置构想：坚持创新教育价值理念；优化课程结构；加强学科建设，提升师资质量；实行完全学分制。