嘉兴地区产NDM-1肠杆菌科细菌流行及传播机制研究

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目的:碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)是临床面临的重大问题,浙江省CRE的检出高,主要以产KPC和NDM酶为主。本研究针对浙江嘉兴地区分离的58株CRE菌株进行碳青霉烯酶耐药基因检测和同源性分析,了解嘉兴地区碳青霉烯耐药的分子流行病学及耐药机制;通过NDM-1耐药基因周围序列分析,阐明产NDM-1肠杆菌科细菌传播机制。  方法:纸片扩散法筛选耐药菌株;琼脂稀释法测定抗生素最低抑菌浓度(MIC);PCR扩增超光谱β-内酰胺酶(blaTEM、blaSHV和blaCTX-M)和碳青霉烯酶(blaKPC-2、blaNDM-1、blaIMP-1、blaIMP-2、blaVIM-1、blaVIM-2和blaOXA-48)基因,研究细菌对头孢菌素类抗生素和碳青霉烯类抗生素耐药的分子机制;脉冲场凝胶电泳(PFGE)研究菌株同源性;多位点序列分型(MLST)对大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌进行ST分型;接合试验研究质粒转移能力;依据PCR的复制子分型对质粒进行分型;杂交试验确定携带blaNDM-1质粒大小;PCR扩增blaNDM-1基因周围序列。  结果:58株肠杆菌科细菌对亚胺培南和美罗培南耐药;对其进行碳青霉烯类抗生素耐药基因检测发现,29株含有碳青霉烯酶NDM-1,且菌株对碳青霉烯类抗生素和头孢类抗生素均耐药;产NDM-1菌株中,86.9%(26/29)合并ESBLs耐药基因出现;产NDM-1菌株中,7株同时含有NDM-1和KPC-2;一株同时含有NDM-1和IMP-4;一株同时含有NDM-1和VIM-1。对产NDM-1菌株进行PFGE分析发现,存在同一克隆菌株在医院内分布流行现象;多位点序列分型首次对产NDM-1阴沟肠杆菌进行分析,五株阴沟肠杆菌为ST114;除两株(ECL-8,CF-17)菌株外,其他27株产NDM-1菌株均将携带NDM-1质粒接合进入大肠埃希菌J53;杂交试验发现携带blaNDM-1质粒位于50-300kb大小质粒上并且多数质粒分型为IncX3型质粒;对菌株进行NDM-1周围环境分析发现,有5株细菌周围环境与先前全质粒测序质粒pNDM-HN380同源性>99%,并且blaNDM-1-bleMBL-trpF组成的转座子几乎存在于所有产NDM-1菌株中。  结论:NDM-1已成为浙江嘉兴地区碳青霉烯类抗生素耐药的主要原因。相同菌种存在同一克隆株的传播流行现象。不同菌种细菌存在相同的blaNDM-1基因编码质粒广泛传播。多数blaNDM-1基因编码质粒中存在相同的转座子。
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