随着经济的发展,科学技术在经济发展中的作用也日趋重要,各国政府纷纷加大对科技的投入促进技术的创新,从而促进经济发展。我国近几年经济发展突飞猛进,财政资金对科技的投入也不断增大,但在全球范围内我国以创新技术为支撑的企业的市场占有率较差,并未实现通过支持企业技术创新从而增强经济实力。基于上述背景,本文以内生经济增长理论为理论依据,分析了财政资金支持企业创新的必要性、财政资金投入与企业创新的关系及财政资金支持企业创新机制的现状。并以此为基础,利用了科技统计数据分析了企业研发投入的现状及财政资金的支持情况,结合创业风险投资现状探讨了我国财政资金支持企业技术创新存在的问题。随后通过建立模型验证了不同性质的企业对研发投入产生的效益不同,说明了我国财政资金资助企业创新的方式不能一概而论,应该有的放矢。研究得出的主要结论有：①我国社会研发资金投入以企业资金为主,但真正意义上企业在创新体系中的主体地位并未确立——虽然企业每年投入研发资金很多,但真正进行研发活动的企业较少。由此表明,我国财政资金引导企业进行创新的目的并未实现。②通过分析我国企业研发投入中政府资金的情况,表明目前财政资金对企业研发投入的方法单一,导致支持企业的类型有偏好,并且缺乏监管机制,造成财政资金使用的低效益,也未能带动社会资金的进入。最后借鉴经济发达国家采用的政府创新资助的方式,提出我国财政资金支持企业技术创新需要在继续增加资金投入规模的同时,根据企业的特点、不同的发展阶段采取不同资助方法,并且要建立财政资金使用的监督和评价机制。