芍药(Paeonia lactiflora Pallas)属芍药科芍药属芍药组(Paeonia)植物。芍药不仅是我国传统名花,也是世界著名花卉,具有极高的观赏、药用价值。芍药为广域种,主要分布于东亚(韩国、日本、中国)。历史上野生芍药在中国北方地区大面积分布,由于过量挖掘、自然灾害、以及其它人为活动影响,天然芍药居群现已处于濒危状态,分布区面积大幅减少。目前,天然芍药在中国大陆的分布包括从大、小兴安岭至阴山、秦岭狭长地带。芍药为多年生草本,异交为主,微弱近交,以昆虫(蜂类)为主要传粉媒介,种子为重力传播,结实率低。　　 本文借助扩增片断长度多态性(AFLP)分子标记技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术研究天然芍药居群的遗传多样性及遗传变异分布,小尺度空间遗传结构,以加深对芍药天然居群遗传结构的认识。　　 利用6对AFLP引物组合,对芍药三个天然居群共80株个体(内蒙古宁城黑里河保护区、河北赤城大海陀山、山西交城俞嶺山)进行了分析检测,共得到249个AFLP位点信息,其中99个多态位点。遗传多样性分析结果显示居群内遗传多样性水平低(Nei’s遗传多样性均值为0.12,Shannon系数均值为0.17,多态位点百分率均值为32.5％)。AMOVA分析结果显示80.5％的遗传变异发生在居群内部,居群间的变异仅占总变异的19.5％。UPGMA聚类图显示来自同一地域的个体聚在同一枝内(仅大海陀2株个体例外),居群内部无显著的亚居群分化。　　 三个居群内个体间遗传距离和地理距离Mantel测验结果表明二者显著相关(P=0.01),但相关系数值偏低,黑里河居群的Rxy值是0.209,大海陀和嵛嶺山的Rxy值分别为0.221和0.357。ANOVA分析发现:居群间遗传距离值相近,黑里河、大海陀、嵛嶺山样本间遗传距离的平均值分别是5.0、5.4和5.2,但存在极显著差异。Mantel检验散点图表明居群内个体具有高遗传距离特征(4-6)且集中分布,遗传变异幅度窄。　　 空间自相关分析发现芍药天然居群在30米范围内具有显著但强度低(r＜0.08)的空间遗传结构,30米之外则缺乏显著的空间遗传结构。我们认为30米内的空间遗传结构是受限制的种子流所致。30米外无空间遗传结构是受强自然选择的结果。　　 对濒危物种的保护是否恰当取决于我们对其了解多少,居群的遗传和空间结构如何?该物种遗传多样性如何?本研究以芍药为对象,尝试分析研究濒危物种天然居群的遗传和空间结构,其结果有助于制定保护策略和进一步探讨芍药天然居群遗传结构形成的机制。