转基因植物大面积商业释放会给生态环境带来潜在而巨大的风险。目前对转基因植物商业释放的风险分析与安全评估研究还处于初级阶段,缺乏行之有效的安全评价方法用于生产实践。为建立一套转基因植物生态环境风险评估体系,本文对其风险分析与安全评价方法进行了初步探索,其研究内容主要包括以下几方面：(1)运用安全系统工程中的因果分析法与事故树分析法,结合转基因植物生态风险问题进行了系统风险源辨识。根据因果分析图与层次分析法对风险主干因素的分析,结果显示基因漂流是引起转基因植物生态环境风险的首要主干原因；而后运用事故树分析对处于底层的基本原因事件进行分析,其中自播转基因植株在结构重要度分析中占有重要地位。据此风险源辨识结果将基因流与自播植株的生态风险作为转基因植物风险分析与安全评价的重点。(2)利用复杂系统的网络拓扑结构分析与社会网中的小团体理论,构建了转基因植物基因流风险的网络分析法。该方法主要包括转基因植物基因流网络构建、网络结构特性分析、小团体分析与结构同型性分析四个基本步骤。以1989-2008年二十年间的常规油菜与十字花科植物杂交文献实验数据为基础对该方法进行了实例演示,研究表明油菜基因流网络的节点度服从幂律分布,具有无标度特性,网络特性分析显示该网络在受到随机攻击时具较好的鲁棒性,而受到恶性攻击时具极弱的抗攻击性,小团体和结构同型性分析可将网络中298个节点22类十字花科植物划分为2个小团体和5类结构角色,其中甘蓝型油菜在油菜基因流网络小团体中具有关键性作用。这些演示结果表明基因流风险的网络分析法可有效进行转基因植物基因流风险规律划分。(3)在基因流风险的网络分析基础上,为进一步细化转基因植物与同源物种之间风险规律关系,运用TOPSIS排序法与粗糙集综合权重确定法相结合,构建了转基因植物基因流风险排序集成模型。基于甘蓝型油菜与其近缘种间的杂交组合研究文献与《中国植物志》中甘蓝型油菜的近缘植物的生物学特性描述,运用该模型对甘蓝型油菜与其近缘植物的基因流风险排序进行了演示。结果显示该模型能将甘蓝型油菜与其近缘植物之间的基因流风险按从大到小或从小到大的规律进行一一排序,进一步深化了基因流风险的网络分析法结论。(4)利用模糊集重心理论与熵值权重确定法相结合,构建了转基因植物营养生长速率等级安全评价模型。模型包含方差分析、建立营养生长速率等级分类标准值、评价指标正态隶属函数确立、模糊集重心理论计算指标重心向量集、熵值法计算评价指标权重向量和营养生长速率等级划分等六个基本步骤。并利用湖南省具代表性的芸苔属作物杂交组合和营养生长指标实测值对该模型进行了演示。论证了该模型能较好区分芸苔属作物各物候期的营养生长速率的安全等级。(5)基于模糊数学中模糊聚类分析与模糊模型识别,并结合生物统计学相关知识,构建了转基因植物基因流安全等级评价模型。该方法包含转基因植物种间组合亲和性的模糊聚类分析、模糊聚类结果F检验、种间组合风险等级划分和风险等级模式识别四个基本步骤。并在等级模式识别步骤中针对样本数据收集情况的不同,构建了不同的等级识别方法,与传统聚类的硬性划分相比更具灵活性。以常规油菜杂交研究文献的实验数据对该方法进行了演示,将这些杂交组合聚类形成六个风险等级模式,并用研究文献资料中的一杂交组合数据为待识别样本进行风险等级识别,识别结论与文献结论相符,论证了该方法具可操作性。最后,基于风险规律与安全评价方法构建的基础上,提出了转基因植物风险控制的网格化管理模式和生物安全立法建议。