高职教育正在逐渐从规模发展转向内涵发展，而科研活动和科研能力是高职院校办学水平的重要参照指标，是发挥学院功能、实现学院价值、彰显学院特色、提升学院认可度的重要方面。高职院校科研管理信息系统可以实现科研管理工作的数字化、流程化，进而提高工作效率。　　本文提出了基于工作流理论开发高职院校科研管理信息系统的设想，通过对科研管理信息系统的工作流程和业务需求的分析，在普通Petri网建模技术的基础上，引入一个管理变迁（M），解决系统执行柔性的问题，实现对高职院校科研管理信息系统的设计，力求构建一个高效、稳定、便捷的科研管理信息系统平台。第一章阐述了系统开发的背景意义、RMIS研究现状以及论文的研究思路、主要内容；第二章介绍了工作流理论和Petri网技术；第三章主要对科研管理的现状和业务流程进行分析，并提出现有科研管理存在的问题；第四章系统需求分析，主要对系统功能结构、用户权限、系统可行性等几个方面进行分析；第五章系统设计，针对提出的问题，通过用Petri网对主要工作流程进行工作流定义、建模和优化，力求解决系统柔性问题，并以“项目申报子系统”为例进行了开发设计；第六章对全文进行了总结。