七十年代我国召开第一次环境保护工作会议以来，经过四十年的努力，环境保护体系已经在我国初步建立和完善起来，国家相继出台了一系列的政策法规，可持续发展战略的确立，将我国的环境保护工作提到了一个新的高度。在工业污染防治中，我国政府高度重视、企业在政策指引下对于污染治理投入巨大、但是真正的环境绩效却相当低下。这其中就需要考虑到在治理工业污染中的各个利益主体间的关系，为了维护自身利益产生各类博弈，影响我国工业治理目标的实现，对于整个社会的可持续发展非常不利。因此，本文从各个利益主体的博弈行为入手，寻找产生利益冲突博弈的原因，试图从深层次的制度分析找出应对策略，协调好利益主体间的关系，促进工业污染防治工作的开展，确保国家环境目标的实现。在治理工业污染中，环境的公共属性导致市场机制的调节作用失效，在以往的政策中，强调治理污染的技术创新，国家也投入了相当大的精力进行整改，但是在环境保护工作中市场失灵的出现不可避免，那么我们就要从政府做起，杜绝政府失灵现象，环境技术手段发展已经相对成熟，只有通过制度创新才能弥补由于政策漏洞造成的绩效低下，确保环境保护工作的高效率——这是本文研究的现实意义所在。通过分析我国治理工业污染中各方利益主体（包括政府、企业、公众。政府又详细分为中央政府和地方政府，两者同样存在着利益的冲突）的博弈行为，找出原因——我国以GDP为导向的发展战略严重影响了利益主体的行为判断，价值取向的扭曲导致政策执行的偏差。要从根本上解决这种矛盾，就要从制度入手，改变现有GDP至上的观念，建立绿色GDP核算机制。为了协调各地区间的关系，可以采取环境保护补贴制度，保证环境保护者从中受益，减少“搭便车”行为的发生。增加公众的参与，大力发展NGO，提升公民环保责任意识，加强社会监督，维护可持续发展。相较于其他研究成果，本文把治理工业污染中的各种利益博弈进行分析，中央政府和地方政府的上下级博弈，地方政府之间的平行博弈，政府与企业的直接博弈，把各种影响到政策推行的因素综合考虑，提出制度创新才是解决工业污染问题，搞好环境工作的根本出路。