随着2007年《农民专业合作社法》的正式颁布与实施,我国的农民专业合作社依法步入规范化的发展轨道。然而,历经了几年的探索,当前农民专业合作社在制度安排与运营管理上,还存在着诸多问题,研究和探讨农民专业合作社的制度安排与运营绩效,对于提高我国农业生产经营效率、增加农民收入有着重要的意义。本研究以农民专业合作社绩效评价为中心,结合当前时代背景,在定义了农民专业合作社绩效评价概念的基础上,以实际调查的我国387家农民专业合作社为例,从农民合作社绩效评估的原因及意义、评价指标体系设计、绩效评估方法选取到最终形成完整的农民合作社绩效评价体系,进行多方面严密的论证,最终得出各个合作社的绩效得分并排名。在已知绩效得分的基础上,从产权制度、管理制度、分配方式、社长情况、外部支持(政府支持以及获得融资情况)等几个方面出发,建立以绩效为被解释变量的结构方程模型,以测度各方面因素对合作社绩效的影响,找到影响合作社绩效的根本原因,并在此基础上,提出有利于我国农民专业合作社绩效水平进一步提升的政策建议。