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禽流感(Avian influenza AI)是由正黏病毒科A型流感病毒引起的一种禽类感染或/和疾病综合症,几乎所有的家禽及野禽都可发生。禽流感病毒根据致病力的不同分为高致病性禽流感(HPAI)和低致病性禽流感(LPAI), HPAI能导致禽类100%死亡率,该病被世界卫生组织规定为必须通报的疫病,也被我国列为一类动物疾病。HPAIV不仅可使禽类发病,同时可感染人发病并致死亡,因此,具有重要公共卫生意义。地理信息系统(Geographica Information Systems, GIS)技术是20世纪60年代发起的一门介于地球科学、信息科学、空间科学之间的交叉科学。GIS将空间数据信息(地图)及社会属性信息(数据库)结合起来,通过分层技术实现图和数据库的共同处理和查询分析,图文并茂、形象直观。目前,GIS已经广泛应用于多领域。本论文通过江苏湿地野生水禽禽流感流行病学调查,结合江苏省水域分布、野生水禽分布、野生水禽携带禽流感病毒情况,运用GIS分析野生水禽禽流感的风险指标,研究结果对江苏禽流感的发生预警起一定作用。1野生水禽禽流感病毒流行病学调查参照Joanna S.Ellis和Maria C.Zambon设计的流感病毒的M基因的引物,建立A型流感病毒的套式PCR检测方法,检测2009年春季至2011年的春季从江苏省的洪泽湖湿地自然保护区采集的已知品种的8种野鸭及未知品种的野鸭共145份泄殖腔拭子,结果显示13%的野鸭带有禽流感病毒,其中秋沙鸭的带毒率最高,在2010春的洪泽地区达到了50%。2一株水禽源禽流感毒株的全基因序列测定利用E. Hoffmann等设计的流感病毒通用引物,对一株从斑嘴鸭分离到的病毒A/Spot-billed Duck/Hongze/01/11(H4N2)进行全基因组测序,分别扩增它的HA、NA、 PA、PB1、PB2、NP、M、NS8个节段的基因,将扩增产物克隆到pMD18-T载体上,连接转化测序,用DNAStar软件进行序列同源性分析,MegAlign软件绘制进化树,分析此株病毒的分子生物学特征。结果表明,8个基因均包含相应的病毒基因的完整开放阅读框。此株病毒的HA氨基酸在237-238处,是禽源病毒的G-Q,其裂解位点序列为PEKASR,没有连续的碱性氨基酸的插入,符合低致病性毒株的特征。本株病毒的PB2蛋白的627位为谷氨酰胺,NS1蛋白92为甲硫氨酸,NS1蛋白编码230个氨基酸,没有缺失。根据其分子特征可以断定这株病毒为低致病力的禽流感病毒。3运用GIS技术进行野生水禽禽流感的风险评估依据实验室多年的流行病学调查收集的数据,结合江苏省水域地理信息图,通过计算机软件设计GIS信息变化图。