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微RNA(microRNA，miRNA)与干扰小RNA(small interfering RNA，siRNA)近年来的研究拓展了人们对真核生物中基因调控与信号通路的认识。tRNA小片段(tRNA fragments，tRF)是一类新的发挥调控作用的小RNA，广泛存在于从贾第虫(Giardia lamblia)到人(Homo sapiens)等众多的真核生物中。而最近二十年中在原核生物大肠杆菌(E.coli)中也发现了80几种的小非编码RNA(sncRNA)的工作机制，E.coli中是否也存在具有生物学功能的tRF未有研究报道。 本研究探索了E.coli中tRF可能的调控作用。首先，在电泳迁移实验(EMSA)中发现3条分别从tRNAAla(GGC)，tRNALeu(CAA)与tRNAGly(TCC)来源的tRF能够特异性的结合原核来源的Sm同源蛋白质Hfq。Hfq被报道参与sncRNA与靶标mRNA上互补序列的配对，表明以上tRF可能在E.coli中发挥调控作用。通过生物信息学的sncRNA靶标预测软件TargetRNA的预测与实验验证，证实了tRNALeu(CAA)来源的tRF能与Hfq以及烟酸单核苷酸-腺苷转移酶基因的mRNA nadD在体外形成复合物，但不能抑制其基因表达;而tRNAGly(TCC)来源的tRF强烈抑制了gcv启动子调控因子gcv的体外表达。此外，在E.coli体内诱导表达tRNAGly(TCC)来源的tRF，在表达谱上至少有4个蛋白质的含量明显差异，表明这类tRF的确能在体外发挥调节功能。以上的研究较好地阐释了E.coli中的tRF可能的调控功能。