目的：　　评估中药联合自体造血干细胞移植治疗重症难治性自身免疫病的临床疗效。　　资料与方法：　　对7例难重症治性自身免疫性疾病患者，其中系统性红斑狼疮(SLE)4例，重症肌无力(MG)2例，多发性肌炎(PM)1例，进行自体造血干细胞细胞移植。预处理采用FAC方案：氟达拉滨、抗胸腺细胞球蛋白和环磷酰胺。移植后根据患者情况进行中医辨证论治，给予中药口服。　　结果：　　所有患者移植过程中并发症明显减少，均顺利动员到足够干细胞，造血功能均顺利重建，临床症状体征改善显著，疾病的实验室指标转阴或显著下降，所用药物停药或减量。　　结论：　　对于重症难治性AID，ASCT是一可供选择的有效方案，在移植过程中联合中医药治疗，可加快患者造血功能的重建，减少移植的并发症，近期临床症状体征改善显著。但移植过程中是否需体外净化淋巴细胞、远期疗效如何、复发后的处理等问题，都需要进一步临床研究。