水稻纹枯病是在世界范围内造成严重经济损失的水稻病害之一,导致水稻产量和品质严重下降。东北三省作为我国主要的水稻生产区之一,水稻纹枯病发生广泛。在实际生产中的水稻主栽品种多为感病品种,防治手段高度依赖化学防治,在缺乏抗性种质资源的条件下,如何绿色防控水稻纹枯病,是目前水稻生产面临的突出问题。现有的研究表明,除立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）外,一些丝核菌属其它真菌也是水稻纹枯病的致病菌。为了解水稻纹枯病菌在东北三省的分布及其遗传结构,分析各个类群的进化趋势,科学防治水稻纹枯病,本研究对采集自东北三省13个水稻主产区的水稻纹枯病样品进行分离与鉴定,测定了病原菌的致病力、菌丝融合群以及对申嗪霉素的敏感性,利用16对SRAP引物对病原菌进行遗传多样性分析,得到以下结果:（1）共分离得到207个菌株,其中立枯丝核菌176个,占比85.02%;水稻丝核菌（R.ory zae-sativae）31个,占比14.98%。其中在各地区都分离到立枯丝核菌,只在黑龙江省部分地区和辽宁省部分地区分离到水稻丝核菌。因此,立枯丝核菌为东北三省水稻纹枯病菌优势菌株。（2）除3个未知菌株外,东北三省立枯丝核菌优势融合群为AG1-ⅠA,占比90.34%;AG-4融合群占比6.81%;AG1-1C融合群占比1.14%,且菌株的融合群类型与其地理分布无明显关系。（3）东北三省立枯丝核菌菌株致病力存在差异,中等致病力菌株为优势菌株,占比61.90%,且菌株致病力与其地理来源有相关性。东北三省水稻丝核菌菌株致病力存在差异,中等致病力菌株为优势菌株,占比74.19%,且菌株致病力与其地理来源没有相关性。两种菌株的致病力与UPGMA聚类分析结果无相关性。（4）东北三省176个立枯丝核菌菌株的UPGMA聚类分析结果与其地理来源具有相关性。东北三省13个地点立枯丝核菌群体遗传多样性具有差异,其中黑龙江省佳木斯市菌株群体遗传结构较为复杂,吉林省松原市菌株群体遗传结构较为简单。各立枯丝核菌群体间遗传距离和遗传相似度、遗传分化系数和基因流与地理位置直线距离没有相关性。其中吉林省松原市立枯丝核菌群体较为特殊,具有成为独立群体和更大遗传变异的潜能。立枯丝核菌群体的地理分布对整个种群的遗传分化和基因交流具有一定影响,在空间上各地点立枯丝核菌群体产生相对的地理隔离。AMOVA分析表明,东北三省立枯丝核菌群体的遗传变异主要来自于各群体内部。（5）东北三省31个水稻丝核菌菌株的UPGMA聚类分析结果与其地理来源具有相关性。东北三省5个地点水稻丝核菌群体遗传多样性具有差异,其中黑龙江省哈尔滨市阿城区菌株群体遗传结构较为复杂,辽宁省沈阳市辽中区菌株群体遗传结构较为简单。各水稻丝核菌群体间遗传距离和遗传相似度、遗传分化系数和基因流与地理位置直线距离没有相关性。其中辽宁省2个地点间地理距离最近,而遗传距离和遗传分化却极大,基因交流弱,原因可能是土壤条件和气候条件的差异导致两地点菌株面临不同的选择压力,其遗传物质作出定向选择的结果。水稻丝核菌群体的地理分布对整个种群的遗传分化和基因交流具有一定影响,在空间上各地点水稻丝核菌群体产生相对的地理隔离。AMOVA分析表明,东北三省水稻丝核菌群体的遗传变异主要来自于各群体内部。（6）东北三省立枯丝核菌对申嗪霉素的EC₅₀值在0.0487～0.2348μg/m L之间,敏感基线为0.1292μg/m L,所有供试立枯丝核菌菌株均为敏感菌株。东北三省水稻丝核菌对申嗪霉素的EC₅₀值在0.0517～0.1697μg/m L之间,敏感基线为0.1163μg/m L,所有供试水稻丝核菌菌株均为敏感菌株。申嗪霉素对立枯丝核菌和水稻丝核菌的菌核萌发没有影响。东北三省立枯丝核菌和水稻丝核菌对申嗪霉素的敏感性与这两种菌株的地理来源、致病力和UPGMA聚类分析结果无关。