从20世纪90年代开始,随着知识经济的兴起,国际上对于国家创新系统中知识转移的研究得到越来越多的重视。希望通过知识转移的研究,分析制约国家创新系统中各创新主体之间的联系,提出改进和提高国家创新系统绩效的措施和途径。技术创新与知识创新是知识经济时代推动经济发展的主要动力。基础研究是国家创新能力平台的重要内容。在知识经济社会里,以科学为基础的专利(science-based patent)在批准专利中所占比例持续增加,而且以科学为基础的专利的质量明显高于非科学基础的专利的质量[1][2]。基础研究是生产科学知识的重要来源,分析和研究基础研究与专利(特别是与发明专利)的知识转移理论,对于提高专利的科技含量,整合国家创新系统中的知识流,提高国家创新系统的绩效具有重要的意义。基础研究和应用技术的发展作为促进科技创新活动、推动经济发展的要素,两者之间的联系以及对经济发展、社会进步的影响一直是众多学者致力研究的问题。基础研究或公共支持的研究如何对科技创新、经济发展和社会进步发挥作用?它产生的效益有多大?这些效益或影响如何评价和测度?这些问题既是研究的重点,同时也是尚未完全解决亟待完善的难点。因此,本文的研究目的在于从国家创新系统的视角,建立分析基础研究与技术创新之间知识流动和关联的评估指标与测度方法,从而对国家创新系统的创新绩效进行分析,并提出改进的政策建议。本文重点研究了国家创新系统中知识转移的基本理论,在系统总结国外有关基础研究与发明专利之间知识转移机制与测度研究经验的基础上,建立我国基础研究与发明专利之间知识转移理论的分析框架;探索将数据挖掘的有关方法和模式移植到专利引文分析,初步构建了应用数据挖掘技术研究国家创新系统中知识转移的基本方法和指标体系,为定量测度基础研究与专利之间的知识转移机制提供了可能,选取了典型案例领域并进行了初步的验证,较全面地分析了目前制约我国基础研究知识转移的若干问题,提出了加强我国基础研究知识创新与技术创新密切结合的政策建议。