随着全球经济的高速发展，我国医药企业对技术创新的重视程度逐渐提高，如何科学客观的评价医药企业的技术创新能力，提高技术创新效率成为迫在眉睫的重大课题。医药产业是世界公认的技术创新成果对专利保护依赖最高的行业之一，而专利作为研究创新和技术进步的重要指标，具有丰富的潜在数据支撑，并且有较长的历史统计基础，因而本文从专利信息分析角度对技术创新能力及相关问题作了较系统深入的研究。　　本文在吸收与借鉴国内外专家学者相关研究成果的基础上，首先，对医药企业、技术创新以及知识产权内涵进行了界定与分类，然后基于此给出医药技术创新与医药专利的概念，技术创新的过程及特征。并从历史演化视角对技术创新与专利制度的关系进行深入论证，得出专利制度对技术创新作用的逻辑模式，为运用专利指标评价企业创新能力提供了理论基础。在此基础上本文运用系统分析和文献分析方法，结合国内外学者对企业创新能力评价的研究、分析，探讨医药企业技术创新能力评价指标体系，并根据评价指标体系选用因子分析等方法进行实证研究。实证研究中将东北三省医药企业的专利申请量及发明专利拥有量与全国及发达省份地区医药企业进行比较，找出其存在的优势和不足，并主要选取东北三省医药高新技术企业作为研究对象，提取其专利信息按照评价体系进行因子分析等评价研究。　　最终得出医药企业技术创新与专利保护间是和谐互动相互交织的系统工程，专利数据基本可以反应企业的技术创新能力水平，而发明专利信息更是评估科技创新能力的核心指标。