科研项目的成效评估作为科研工作最后阶段的重要任务,既可以全面反应科研工作情况,也可以有效引导未来科研立项的方向。数据包络分析的设计目的是同时评估各种影响因素,以计算给定一组产出与投入的最有效情况。因此数据包络分析可以用于科研项目有效分配利用投入资源的评估。本研究主要针对“公益性卫生行业专项”科研项目进行绩效评价。对公益性卫生行业科研专项的3个投入指标包括项目经费、项目组人员数量、流动人员数量与15个产出指标包括硕士毕业人数、博士毕业人数、SCI论文、非SCI论文、专著字数、专利、标准与规范、指南、专家共识、大队列、生物数据库、平台与基地、转化应用、举办会议以及科普出版。本研究利用的DEA模型包含C2R模型、BC2模型和测算规模收益状况的FG模型与ST模型等。分别利用C2R模型与BC2模型获得综合技术效率值与纯技术效率值,而规模效率值则通过前者除以后者得到。本研究对数据包络分析的研究现状以及其在医学领域的应用研究现状借助知识图谱软件CiteSpace进行分析。研究结果显示,总的来看,145个行业专项中107个效率状态较好,在另外的38个行业专项中影响其未达到有效状态的成果指标主要为行业专项设立目的非紧密相关的成果,因此行业专项整体绩效表现较好,有效配置资源并较好的达到绩效目标。145个行业专项的整体纯技术效率值低于整体的规模效率值,因此在行业专项开展期间内部管理的调整的重要程度是高于规模调整的。145个专项中有80个专项纯技术效率值为1,表明这80个专项内部管理和技术状态较好,资金管理运用较为合理。有52个专项在项目内部管理与技术创新方面均具有较为优秀的表现。纯技术效率值不为1的65个专项中,有24项处于规模报酬递增的状态,有3项处于规模报酬不变的状态,因此这27个专项属于运行较为良好的评价单元,增加某一比例的投入可以输出同等比例甚至更高比例的产出。公益性卫生行业科研专项在9年间无论是资助经费还是人员的投入都在增长。在进行了有效的资源配置后产出了大量的成果,共支持发表SCI论文2750篇,出版424部专著,取得899项知识产权成果,编写152个标准规范。对于行业专项较为重要的8项指标尤其是标准与规范、指南、专家共识、大队列有较为出色的表现,尤其在标准规范、指南、专家共识以及大队列有较好的表现。而在方法应用层面,数据包络分析对公益性卫生行业科研专项进行绩效评估是可行的。