牙鲆3种CC型趋化因子的基因克隆、组织表达及分析

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趋化因子是由各种细胞分泌的一类细胞因子。趋化因子在细胞活化,分化,运输和许多生物反应过程起着重要的作用。根据氨基酸序列氨基端前两个保守的半胱氨酸残基的结构,趋化因子分为四个家族:CXC型趋化因子,CC型趋化因子,CX3C型趋化因子和C型趋化因子。最近,在斑马鱼中一种新型的趋化因子CX被发现。在哺乳动物中,CC型趋化因子有28种,是所有趋化因子家族中数量最多的。然而关于硬骨鱼类CC趋化因子的研究,主要集中在趋化因子的基因克隆和序列分析,只有少数研究趋化因子在免疫应答中的功能。本研究克隆和鉴定了牙鲆(Paralichthys olivaceus)三种CC型趋化因子Paol-SCYA105,106和107。通过氨基酸序列比对发现Paol-SCYA105,Paol-SCYA106和Paol-SCYA107与相近物种的氨基酸序列的相似度在59%到67%。通过比对三种CC型趋化因子与其他物种的CC型趋化因子的氨基酸序列,表明三种CC型趋化因子的四个半胱氨酸残基是保守的。系统进化树显示Paol-SCYA105,Paol-SCYA106和Paol-SCYA107分别属于CCL17/22,CCL19和CCL27/28分支。Paol-SCYA105和Paol-SCYA107由3个外显子和2个内含子组成。Paol-SCYA106由4个外显子和3个内含子组成。Paol-SCYA105主要在鳃,肾和脾中表达,在大脑和皮肤表达较弱,在肝脏或肌肉中不表达。Paol-SCYA106在所有组织都有表达。Paol-SCYA107在脾,肾和鳃中表达。在VHSV感染后,Paol-SCYA105在感染后第3天表达量显著增加。Paol-SCYA106在感染后第3天和第6天表达量上升。Paol-SCYA107在感染后第6天表达量达到最高值。在细菌E.tarda感染后,三种新的CC型趋化因子中只有Paol-SCYA106表达量上升。在细菌S.iniae感染后,Paol-SCYA106在感染后第1天表达量最高。在本实验中,发现了三种新的CC型趋化因子Paol-SCYA105,Paol-SCYA106和Paol-SCYA107。序列比对和基因结构分析表明,这三种新的趋化因子属于CC趋化因子。其中两种趋化因子基因表达具有组织特异性。这些趋化因子在病毒和细菌感染的免疫反应中起作用,特别是应对VHSV的感染。
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