罗非鱼是我国当前主要淡水养殖鱼类之一，但是在生产过程中管理不当容易导致罗非鱼种质的遗传渐渗、混杂与退化，表现为生长速度减慢、抗病力减弱、体色不一等，严重影响生产。良种的选择和培育是保证我国罗非鱼产业健康发展行之有效的手段之一。2006年1月"新吉富罗非鱼"通过了国家良种审定并面向全国推广，对于我国罗非鱼的产业发展具有重要意义。但是随选育进程的逐渐推进，选育群体的遗传结构会发生相应变化，而国内外对鱼类选育群体在选育过程中的遗传结构变化尚未有详细研究。因此，我们从表现型、遗传型及遗传一环境互作三个方面，对新吉富罗非鱼选育过程中遗传变化进行跟踪观察和研究。 在表现型方面，吉富品系尼罗罗非鱼生长性能获得显著改良，体重变异系数逐代降低，研究发现体重选择效应为每代4.85％左右。在遗传型性状方面，采用RAPD、SSR、AFLP三种分析和mtDNA分析等多种方法一致表明，随着选育世代数的累进，选育群体的遗传结构出现了变化，主要表现在群体遗传多态性逐代降低，即纯度越来越高：AFLP分析发现了一条出现频率随选育世代累进而显著增高的502bp特异性片段，初步认为可作为鉴别新吉富和其基础群体的遗传标记。另外，还从遗传一环境互作角度，对罗非鱼与表型生长性状有关的几个重要经济性状进行遗传力、杂种优势等分析，以深入了解选育群体的变化机理。