莱茵衣藻中TET-like基因的功能研究

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DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,在生物体的生长和发育过程中发挥重要功能,其中5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)是DNA甲基化的主要形式之一。在哺乳动物基因组的DNA上,5mC在2-OG和Fe2+依赖的TET双加氧酶家族蛋白的催化下,产生5-羟甲基胞嘧啶(5-hydro xymethylcytosine,5hmC),并进一步被氧化生成5-醛基胞嘧啶(5formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC)。近年来在小鼠中对TET功能的研究表明,5mC的氧化可改变基因组原有的甲基化谱式,调控基因的表达,参与个体甚至是个体后代的发育过程。  TET家族蛋白广泛存在于多种生物,如动物、植物、病毒和真菌中,由于不同物种间的TET同源蛋白包含有不同的结构域,推测可能有不同的生物学功能。目前,在哺乳动物中TET家族蛋白的研究已经较为透彻,但在低等生物中,只有阿米巴原虫(Naegleria gruberi)和蘑菇(Coprinopsis cinerea)的少数TET-like蛋白被报道具有氧化5mC的活性,而在其他低等生物中的功能还尚不清楚。本研究我们以莱茵衣藻(Chlamydom onas reinhardtii)为研究对象,检索到八个编码TET同源蛋白的基因,并将其cDNA列克隆到表达载体上。在体外对这些TET-like蛋白进行纯化和酶活分析,惊奇地发现cTet5(Chlamydomonas reinhardtii TET-like protein5,cTet5)不仅可氧化5mC产生5hmC,而且还产生了不同于已报道的新DNA修饰。这一研究拓展了人们对于TET蛋白功能的了解,相关的生物学意义仍在进一步探索中。
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