应用DNA测序和寡聚核苷酸芯片对原发性肝癌中基因突变及变位剪接的研究

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiangcongzhi
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目的:研究原发性肝癌中p53基因、β-catenin基因突变和DNMT3b基因、hTERT基因变位剪接的情况,及其在肝癌发生发展中的作用。 方法:通过RT-PCR、DNA测序结合寡聚核苷酸芯片杂交的方法对30例肝癌、30例癌旁及10例肝硬化、慢性肝炎、正常肝组织中p53基因、β-catenin基因突变和DNMT3b基因、hTERT基因变位剪接体进行检测,并将结果与肝癌病人临床指标进行统计学分析。 结果:RT-PCR结果显示β-catenin基因在96.7%(29/30)的肝癌、96.7%(29/30)的癌旁组织及全部正常肝组织有表达,表达强度在肝癌组强于癌旁组和正常组(p<0.05)。p53基因在93.3%(28/30)的肝癌、93.3%(28/30)的癌旁组织、90.0%(9/10)的正常肝组织中有表达,表达强度在肝癌组与其他两组无差异(p>0.05)。DNMT3b基因以四种变位剪接体(DNMT3b1、DNMT3b3、DNMT3b4、DNMT3b5)的形式表达,其总的表达率为肝癌组93.3%(28/30)、癌旁组93.3%(28/30)、正常组100.0%(10/10)。其中DNMT3b4在肝癌组中的表达高于癌旁组(p<0.05)。hTERT基因在以四种变位剪接体(全长转录体、α剪接体、β剪接体及αβ剪接体)的形式表达,总的表达率为肝癌组77.3%(22/30)、癌旁组43.3%(13/30)、正常组30.0%(3/10)。hTERT基因全长转录体在肝癌中表达高于癌旁组织及正常组织、hTERT基因在癌旁组织和正常组织中以β变位剪接体表达为主。 DNA测序显示:β-catenin基因在肝癌中的突变率为43.8%(7/16),突变位点主要集中在密码子33、37、40、45、50,β-catenin基因突变与肝癌中高表达有相关性(p<0.05),与病理分化和CLIP评分无相关性(p>0.05)。p53基因在肝癌中突变率为15.4%(2/13),肝癌中主要突变位点位于密码子235、248、278。 寡聚核苷酸芯片杂交结果显示在β-catenin基因45密码子检测到TCT→TTT的突变,在β-catenin基因其余位点及设计的p53基因的突变位点均未检测到突变型杂交信号。DNMT3b基因、hTERT基因均检测到全部四种变位剪接体的杂交信号。 结论:p一。atenin基因在肝癌中的突变及高表达可能与肝癌的发生相关。DNMT3b基因变位剪接体4可能参与肝癌的发生.hTERT基因在肝癌中的高表达及其全长转录体的再表达可能参与肝细胞由正常向肝癌的转变。
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