基于最大信息系数的柑橘黄龙病差异表达基因分析

来源 :赣南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:alex_juve
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
柑橘黄龙病是柑橘生产中的严重灾害,被称为柑橘“癌症”,对全球柑橘产业造成了巨大的破坏。利用基因的差异表达信息,可以精确地洞察生物学过程和功能紊乱,并发现相关的致病基因,明确黄龙病菌对柑橘基因表达的关键影响。研究把一种新型的非参数统计方法最大信息系数引入到柑橘黄龙病差异表达基因识别,并与常用的Rank Products和Wilcoxon符号秩检验两种方法对比分析,讨论了最大信息系数在柑橘黄龙病差异表达基因识别中的可行性及有效性。基于柑橘黄龙病基因表达数据集GSE33459的研究表明,最大信息系数方法识别的差异表达基因不仅与对照方法有相同之处,而且该方法在5-9wai数据中还找到了较Wilcoxon符号秩检验法多8437个新基因,较Rank Products法多8892个;在13-17wai数据中较Wilcoxon符号秩检验法多10189个,较Rank Products法多11611个。虽然三种方法得到的差异表达基因数有明显不同,但最大信息系数与其它两种方法的富集分析结果占比基本相同,从而说明最大信息系数在识别差异表达基因上没有偏倚。另外,基于柑橘黄龙病基因表达数据集GSE29633的进一步实验,也验证了上述结果。研究表明,最大信息系数用于柑橘黄龙病差异表达基因的识别是可行且有效的。
其他文献
帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一种以中脑黑质致密带(Substantia nigra pars compacta,Snpc)路易小体(Lewy body,LB)的形成以及多巴胺(Dopamine,DA)能神经元的变性和丢失为主要病理特征的常见神经退行性疾病。其主要临床症状分为两类:运动症状、非运动症状。运动症状主要包括:禁止性震颤、肌强直和运动迟缓。非运动症状主要包括:
神农香菊(Chrysanthemu indicum var.aromaticum)是近几年发现的野菊(Chrysanthemum indicum)一变种,其花、叶、根均具有浓郁的香气,可用于精油提取、药材加工,是一种极具药用开发价值和园林应用价值的植物。神农香菊主要的有效成分有两类:挥发油、黄酮类化合物。在类黄酮代谢途径中花色素苷生物合成途径是其重要分支,研究类黄酮代谢途径对园林植物花色的改良具有
目的:分析动脉瘤性蛛网膜下腔出血(aneurysmal subarachnoid hemorrhage,aSAH)头皮脑电图特点(electro-encephalogram,EEG),比较EEG不同波形特征与aSAH继发癫痫的关系,探讨头皮脑电图波型对aSAH后癫痫发生的预测价值。方法:回顾性分析我院神经外科2014年1月至2017年1月312例aSAH患者脑电图资料,出院后平均随访半年以上。按照
高红外发射率涂层因其在节能环保领域具有较高的应用价值而受到国内外诸多研究者的关注。目前国内外对于高红外发射率材料的研究主要集中在尖晶石型、堇青石型、钙钛矿型以及多金属复合体系等领域。材料的复合是一种有效的提升材料性能的方法,除了引起掺杂效应外,还有可能生成与原体系完全不同类型的新型材料。本文在镍铬氧化物体系(Cr_2O_3和NiO)中添加氧化硼进行复合,通过旋转喷雾造粒制备团聚的复合粉末后于140
目的:通过研究糖肾康饮及其拆方组含药血清对高糖环境下体外培养的肾小球系膜细胞(GMCs)的增殖抑制作用,以及各组含药血清对于高糖诱导的细胞转化生长因子β1(TGF-β1)及层黏
柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)是目前柑橘种植产业中最具毁灭性的病害之一。目前,世界上大部分柑橘种植区都面临着HLB的威胁,我国南方柑橘主栽省份也因为HLB的爆发给
TFT-LCD是目前使用最广泛的平板显示器之一,随着技术的发展台式液晶显示器、笔记本液晶显示器、手持式液晶显示设备越来越普及,其对应的显示器薄化成为发展趋势,抛光工序作为
会议
第一部分 前房维持器在猪眼后囊破裂模型白内障摘除术中的有效性和安全性研究目的 在猪眼晶状体后囊破裂模型中应用前房维持器辅助行白内障超声乳化吸除术,验证有效而安全的ACM灌注压力。方法 将42只猪眼随机分为7组,每组6眼,制造后囊破裂模型后,均在ACM维持前房下行白内障超声乳化吸除术。前房维持器灌注瓶高度(Bottle Height,BH)设置为40cm、50cm、60cm、70cm、80cm、90
研究目的:本研究从儿童咽喉反流(Laryngopharyngeal reflux LPR)的病理、临床表现、诊断、治疗及转归进行概述,总结LPR与儿童呼吸道疾病的关系。呼吸系统疾病是门诊患儿的常见症状,为数不少的患儿通过传统的诊断治疗方法,并未得到满意的效果。通过研究,提示有相当一部分难治性呼吸系统疾病与病理性的咽喉反流有关。本研究帮助儿科医师更好的认识及诊断LPR。研究方法:1.2015年9月至
东北地区地理环境特殊,冬季漫长而寒冷,夏季温暖湿润却短暂,能够在东北露地越冬的植物种类较少,自然分布在东北地区的狭叶黄芩(Scutellaria regeliana Nakai)为多年生草本,花为紫色,是一种优良的野生观赏植物,可作为地被植物在园林中应用。本文以狭叶黄芩为研究对象,建立不定芽再生体系以及愈伤途径再生体系,并研究外源施加茉莉酸甲酯对干旱胁迫下狭叶黄芩生理生化的影响,为狭叶黄芩野生资源