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目的：研究脊髓小脑性共济失调3型/马查多-约瑟夫病(spinocerebellar ataxia type3/Machado-Joseph disease, SCA3/MJD)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells, PBMCs)中ATXN3基因启动子区DNA甲基化水平,研究ATXN3基因启动子区DNA甲基化水平与CAG重复序列拷贝数、SCA3/MJD发病年龄及ATXN3基因mRNA表达水平之间的相关性。方法：共收集71个SCA3/MJD家系的141例患者作为本研究的病例组和112例健康个体作为对照组。采用密度梯度离心分离SCA3/MJD患者和正常人的PBMCs;采用重亚硫酸盐测序法(bisulfite genomic sequencing PCR, BSP)检测ATXN3基因启动子区2个CpG岛的DNA甲基化水平；采用T载体克隆测序检测SCA3/MJD患者ATXN3基因的CAG重复序列拷贝数；采用实时荧光定量PCR (real-time quantitative PCR, qRT-PCR)方法检测ATXN3mRNA的表达水平。结果：1.通过BSP技术验证了ATXN3基因启动子区2个CpG岛的甲基化水平,CpG岛1(距离转录起始位点较远)呈高甲基化水平,CpG岛2(距离转录起始位点较近)呈低甲基化水平。2. SCA3/MJD病例组ATXN3基因启动子区CpG岛1的甲基化水平较对照组明显(82.61±3.97vs78.97±2.22, p=0.00);所收集的71个SCA3/MJD家系中,有7个家系的同一亲代有多个子代,且子代的CAG重复序列拷贝数相同,其中6个家系中发病年龄早的患者较发病年龄晚的甲基化水平偏高。3. SCA3/MJD病例组中,有CAG重复序列动态突变家系中的亲代较未出现动态突变家系亲代,ATXN3基因启动子区DNA甲基化水平偏高(86.04±2.68vs80.04±2.8, p=0.00)4. SCA3/MJD病例组与对照组的ATXN3基因mRNA水平无明显差异(0.51±0.25vs0.46±0.19, p=0.27), mRNA水平与ATXN3基因启动子区DNA甲基化水平无相关性。结论：1.首次利用BSP技术验证了ATXN3基因启动子区2个CpG岛的甲基化水平,岛1呈高甲基化水平,岛2呈低甲基化水平。2.ATXN3基因启动子区DNA甲基化水平与SCA3/MJD患者的遗传早现有关。3.ATXN3基因启动子区DNA甲基化水平与SCA3/MJD患者的CAG重复序列不稳定性有关。