近年来,国外利用ZFX、ZFY基因对X染色体,Y染色体在物种进化方面进行了大量研究。同时采用ZFX和ZFY基因进行性别鉴定研究,其优点在于可靠性高,重现性好,简单方便,另外ZFX、ZFY基因有较大的同源性,可以利用共同的引物扩增,进行基因克隆和测序分析。而国内对此方面的研究却很少,特别是对绒山羊的研究尚未见报道。根据摩弗伦羊(Mouflon)和人(Human)的ZFX、ZFY基因序列以及相关文献设计引物,以雌雄辽宁新品系绒山羊的基因组DNA为模板,用PCR方法扩增并克隆其ZFX、ZFY基因第11号外显子的部分片段,进行序列测序。结果用NCBI的BLAST,生物软件ClustalX.exe、Mega、BioEdit.exe、DNAClub等进行分析。对辽宁新品系绒山羊(Liaoning New-breeding cashmere goat)、藏系绵羊(Tibetan sheep)、摩弗伦羊(Mouflon)、马(Horse)、山狗(Coyote)、猪(Pig)、鲸(Whale)、人(Human)和牛(Cow)的ZFX、ZFY基因的外显子同源性进行序列对比分析。用N-J方法等构建分子系统树。通过各种不同的方法进行多方面的分析比对,分析结果表明:ZFX、ZFY基因两者核苷酸同源性达92%,推导的氨基酸同源性为95%。经分析可知,辽宁新品系绒山羊与摩弗伦羊亲缘关系最近,与其他物种的亲缘关系较远。本研究为探讨物种之间的起源进化关系提供了一定的理论依据。ZFY是Y染色体特有的基因,通过PCR技术扩增Y染色体相关序列,可有效的进行各种生物材料的性别鉴定。利用限制性内切酶AvaII对辽宁新品系绒山羊ZFX、ZFY基因的PCR产物进行酶切,确定AvaII为ZFX基因上的特异酶切位点,以此可以对辽宁新品系绒山羊性别进行鉴定。