西农萨能羊凝乳酶原前体基因的克隆、生物信息学分析及真核表达载体构建

来源 :西北农林科技大学 西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yzqp178
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究参照GenBank收录的绵羊凝乳酶原前体cDNA序列(GenBank No:X53037)设计RT-PCR、PCR与巢式引物,以新生5天的西农萨能羊公羔羊为研究对象,利用手术法采集羔羊皱胃组织,利用Trizol法提取皱胃组织总RNA,经过电泳鉴定后,以总RNA为模板利用RT-PCR方法获得西农萨能羊凝乳酶原前体cDNA序列,以cDNA序列为模板进行扩增和T载体连接测序。利用软件NCBI BLASTn、BLASTp与ClustalW对该基因的测序结果进行序列比对、进化树分析;利用软件Compute pI/MW、MLRC、SignalP V3.0分别分析该基因的物理性质、二级结构与折叠类型、信号肽剪切位点;利用软件FeatureMap3D、SWISS-MODE分析该基因的三级结构与活性中心位点。根据测序结果设计引物,利用酵母整合质粒载体pPICZαA构建重组质粒,电击转化法将重组质粒整合至巴斯德毕赤酵母基因组DNA,筛选鉴定凝乳酶原重组转化子。获得以下研究结果:1.克隆了西农萨能羊凝乳酶原前体基因cDNA序列,全长1292bp,编码381个氨基酸,该基因cDNA序列登录GenBank(GenBank No:EF199763)。序列分析表明,西农萨能羊凝乳酶原前体基因与山羊、牛、绵羊、狷羚、骆驼、狗、人、猪、恒河猴、兔子凝乳酶原的核苷酸同源性分别为99.41%、98.74%、95.29%、95.81%、87.48%、83.69%、81.91%、67.43%、66.74%、66.39%,氨基酸同源性分别为99.21%、98.42%、93.70%、93.42%、83.99%、74.09%、57.22%、56.37%、57.18%、54.18%。2.物理性质分析表明,西农萨能羊凝乳酶原的分子量为大约为42.1kDa,成熟凝乳酶的分子量为35.5kDa,等电点为4.45。3.通过对凝乳酶原前体基因二级结构与折叠类型的分析表明,α螺旋短片段约占总氨基酸的8.36%,β折叠约占总氨基酸的32.82%,α螺旋短片在1-175氨基酸残基组成的N端区域和176-323氨基酸残基组成的C端区域无相同的片段。4.凝乳酶原前体蛋白存在一个16个氨基酸的信号肽序列,信号肽剪切位点分析表明,西农萨能羊凝乳酶原基因的信号肽剪切位点位于Met16-Gly17之间。5.三级结构分析表明:本研究克隆出的凝乳酶原前体基因形成的成熟凝乳酶在244位点为甘氨酸,为B型凝乳酶。两个天冬氨基酸活性位点:Asp32和Asp215,维持活性中心三维构象的氨基酸Thr33、Ser35、Thr216、Thr218、NHGly217和NHGly34,二硫键:Cys45-Cys50,Cys206-Cys210和Cys250-Cys283均无变异,能够形成正确的二裂片三维构象。6.利用设计的引物和酵母分泌型表达载体pPICZαA成功构建了西农萨能羊凝乳酶原前体基因的非融合蛋白和融合蛋白重组表达载体pPICZ-T1、pPICZ-T2,电击转化巴斯德毕赤酵母后,成功将重组西农萨能羊凝乳酶原前体表达质粒pPICZ-T1、pPICZ-T2整合至巴斯德毕赤酵母的基因组DNA,筛选出能够用于表达西农萨能羊凝乳酶原前体基因的非融合蛋白和融合蛋白重组转化子,为凝乳酶表达研究和工厂化生产提供了试验数据。
其他文献
在我国,教育改革已经成为热点问题.教师专业发展培训热火朝天,然而专业化成长的快与慢,涉及太多的因素,基层教师特别是农村基层教师虽然教育观念上有所认识,但受价值取向、性
本试验的主要目的是研究冻融与获能处理过程中,猪精子前顶体蛋白被活化成顶体蛋白的差异。分别将精子在4℃下平衡20min、40min、60min、100min,筛选最适合猪精液的冷冻平衡时
本实验对羊草种内变异与分化进行了系统的研究,发现羊草种内变异多样性较高,在叶色、穗型、穗色、抽穗率高低和叶片的宽窄等方面都存在着明显的变异。对各类型移栽种植结果表明羊草穗型变异不稳定,但不同穗型间种子产量存在着明显差异。宽叶型羊草移栽后性状稳定,且营养价值明显高于普通叶羊草。 羊草的叶色变异主要有黄绿、灰绿和灰色三种类型,各类型在移栽后仍保持不变,表明叶色变异应届可遗传变异,并从形态特征、光
《实用主义》一书具体论述了实用主义的基本观点,其中主要的有实用主义是一种方法;实用主义是关于一种真理的理论等。深刻认识实用主义的利与弊,教育大学生自觉抵制实用主义
在新课改的道路上,我彷徨过,迷惘过,期待着,让我不知路在何方?我渴望有机会能够与专家零距离接触,聆听教诲;我渴望有一个智慧平台,看视频听专家讲座,能与众多教育同行交流思
高效的课堂教学就是以尽可能少的时间、精力和物力投入,取得尽可能好的教学效果,促进学生的全面发展、主动发展和个性发展,使课堂真正变成学生的课堂。在新课改思想的指导下,
探究性学习与接受性学习是人类的两大主要学习方式。接受性学习是在接受他人知识过程中获得经验,探究性学习是在探索、深究、创造的过程中获得经验,这两种学习方式都是学生获
物理是以观察和实验为基础的学科,具有很强的实践性,物理实验在物理学的产生和发展过程中具有重要的地位。在物理课堂教学中,课堂演示实验能调动学生积极、主动地参与到课堂
完全生长的小鼠卵泡卵根据染色质构型分为两种类型,即SN型和NSN型.SN型,即surrounded nucleolus,染色质高度凝集,集中围绕在核仁周围;NSN型,即non-surrounded nucleolus,染色
教人求真、相思真诚,其寓意为教师要成为学生成长中修枝剪叶的巧匠,要达到至高无上忘我的境界,其本意即责任、求真、真诚、真情等。我每日都会对学生相思,于是被同事笑称我被