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第一部分:[目的]证明猪IDO基因的存在,分析并克隆猪IDO基因的编码序列,明确其生物信息学结构特点及表达分布特点。
[方法]运用生物信息学方法从GenBank获得与人IDO基因同源的猪EST序列,通过电子克隆得到预测序列,再经比对得相似度高的猪mRNA序列,然后通过RT-PCR技术在猪血管内皮细胞系PED中验证该序列的准确性,对该序列进行生物信息学分析,并在核酸水平研究其组织表达分布特点。应用体细胞杂交板(somatic cell hybrid panel,SCHP)技术对猪IDO基因进行染色体定位分析。以已公布的人IDO同源蛋白的三级结构为模板,利用生物信息学软件及相关数据库构建猪IDO蛋白的三维空间结构模型。
[结果]通过分子克隆、测序、同源性分析,证实猪存在IDO基因,将结果提交至GenBank,获得登录号为HM209418。猪IDO基因在猪的胸腺、肺、附睾和眼底中有基础水平的表达,尤其在猪外周血单核/巨噬细胞中表达丰富,IFN-γ刺激后猪血管内皮细胞上可表达IDO。
[结论]生物信息学方法指导分子生物学实验,有助于新基因的预测、发现与鉴定。本研究确证了猪存在IDO基因的推测,明确了该基因相关的分子结构信息,为研究猪IDO蛋白的免疫学功能奠定了基础。
第二部分:[目的]分别构建高水平表达天然poIDO分子和带标签蛋白的poIDO融合蛋白的重组表达载体。
[方法]利用RT-PCR扩增猪IDO基因编码区片段,连接至T载体,经测序验证无误后,分别亚克隆至真核表达载体pcDNA 3.1(-)和pCMV-Tag2B,构建重组质粒。将重组质粒和空载体分别转染至CHO细胞和PED细胞,用G418进行筛选;通过Western Blot、免疫化学和免疫荧光等方法检测,鉴定出能稳定表达pcDNA 3.1(-)-poIDO、 pcDNA 3.1(-)的PED细胞亚群和能稳定表达pCMV-Tag2B-poIDO和pCMV-Tag2B的CHO细胞亚群。
[结果]经过双酶切和测序鉴定,重组质粒pcDNA 3.1(-)-poIDO与pCMV-Tag2B-poIDO构建成功。
[结论]成功构建出能表达天然猪IDO分子的载体质粒pcDNA 3.1(-)-poIDO和能表达出融合蛋白pCMV-Tag2B-poIDO,该蛋白可作为猪IDO介导人血清杀伤猪血管内皮细胞作用研究的重要工具。
第三部分:[目的]研究猪IDO在人血清对猪内皮细胞杀伤效果中的作用,并进一步研究其在这一过程中的作用机制。
[方法]利用流式细胞术检测IDO特异性阻断剂1-MT对人血清对PED杀伤效果的影响,由此初步判断IDO对人血清杀伤猪血管内皮细胞的影响。建立用PI单染法检测人血清对猪血管内皮细胞系(SV-40-PED)细胞毒作用的方法。
[结果]人血清对猪血管内皮细胞的杀伤作用显著;在加入1-MT后,人血清对猪血管内皮细胞的杀伤效果受到抑制。
[结论] IDO促进人血清对猪血管内皮细胞的杀伤作用;PI单染法能够方便客观地检测人血清的杀伤效率。