随着公民社会意识增强和政府机构改革推进，非政府组织(NGO)数量越来越多，非政府组织在社会各个领域发挥越来越重要的作用。非政府组织与政府的关系不是停止不前的，在特殊时代背景下会表现出新的现象。本文以在5.12灾后重建调研中所收集到的一个典型案例----“绵竹市遵道镇志愿者协调办公室”(以下简称“协调办”)为例，通过进一步分析此案例对非政府组织与政府的关系加以研究。希望为我国非政府组织与政府的关系研究提供新的思路。　　 本文以非政府组织与政府的关系为主线，首先整理了关于非政府组织与政府关系的相关概念和理论，并通过采用“过程—事件”的叙述方法详细介绍了案例，以此真实展现出在5.12灾后重建中非政府组织与政府的关系变化。其次引入“合法性”概念，从非政府组织与政府的合作关系对非政府组织合法性的影响的角度进一步分析案例，指出非政府组织保证自身政治上正确性是两者合作的前提条件，而行政合法性是非政府组织能以合法身份存在并保护其合法权益的手段。合法性直接影响到非政府组织的存在与发展。而非政府组织合法性的获得过程又需要其加强与政府的合作。此外通过分析目前我国非政府组织与政府的关系是依附性合作关系，为实现非政府组织长远发展和政府改革我们提出应该构建一种有中国特色的新型合作关系。最后，从非政府组织和政府两方面，分析构建新型合作关系的问题，提出具有可操作性的对策建议。