应用多重PCR及第二代测序技术建立乳腺癌易感基因(BRCA1/2)突变检测平台

来源 :中国人民解放军医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xuwei5858
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背景:人类乳腺癌易感基因BRCA1/2与遗传性乳腺癌/卵巢癌发病密切相关。乳腺癌、卵巢癌近年来发病率、病死率逐年增高,遗传性乳腺癌、卵巢癌患者中约存在60%-70%以及80%-90%的机率携带BRCA1/2基因突变,携带该基因致病性突变的患者终身发生乳腺癌、卵巢癌的累计风险较正常人显著提高。伴随着高通量测序技术的兴起,BRCA1/2基因诊断方法得到进一步发展,能够实现高通量、快速、准确且检测成本较一代测序显著降低。多重PCR技术可准确的完成基因信号扩增,与二代测序技术相结合,为BRCA1/2基因检测提供更加高精准度、快速简易的检测方法。目的:建立基于多重PCR及高通量测序技术的平台用于检测BRCA1/2基因全部外显子序列以及外显子内含子拼接区突变,并验证其敏感度及特异度。方法:1,构建扩增BRCA1/2基因全部外显子序列以及外显子内含子拼接区的多重PCR技术,并通过二代测序技术平台对多重PCR后建立的BRCA1/2基因文库进行测序。以北京大学肿瘤医院5名经一代测序技术检测具有明确致病突变位点的患者为研究对象,通过与一代测序、目标序列捕获测序结果进行比对,对该方法进行验证。2,收集中国人民解放军总医院妇产科临床可疑高危BRCA1/2基因突变携带者7名纳入研究,其中已诊断卵巢癌患者4名,无症状携带者3名。所有入组受试者之前均未行明确基因诊断。受试者通过mPCR-NGS技术对BRCA1/2基因全部外显子序列以及外显子内含子拼接区进行基因检测,对于发现的致病性突变进行Sanger测序,验证检测突变位点准确性。结果:1, mPCR-NGS测序与Sanger测序、目标序列捕获测序比对结果相符。2,经mPCR-NGS测序平台检测7例高危BRCA1/2基因突变患者,未发现致病突变,同时发现非同义cSNP,经Sanger测序验证结果一致。结论:1,mPCR-NGS测序平台检测BRCA1/2基因突变位点具有较高特异度及灵敏度。2,与传统Sanger测序、目标序列捕获测序相比,mPCR-NGS测序平台具有操作便易、时间短、消耗成本低的优势。
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