系统评价既是系统分析的后期工作，又是决策分析的前期工作，在系统工程理论和方法体系中处于“枢纽”地位，是系统理论中最重要的核心部分，在各种应用系统工程理论与实践中具有广泛的应用价值。从最初单一的工程系统评价开始，系统评价现已经被广泛的应用于自然科学以及人类生产生活的方方面面。 由于科技的发展，人类社会已经进入了有形和无形的、异常复杂的网络化社会，系统评价问题也随之上升到复杂性科学的层面上。模糊综合评判和层次分析等方法在复杂系统评价中得到了较为广泛的应用。但随着人们对复杂性科学理论的深入认识，这些方法也显现出其一定的局限性，于是近几年出现了基于语言信息处理的专家群决策的评价方法，在一定程度上解决了上述方法的局限性。针对复杂系统而言，由于复杂系统本身具有的复杂性决定了复杂系统的评价需要将复杂性科学理论的研究成果引入到复杂系统评价之中，还原复杂系统评价的复杂性本质。 文章在肯定模糊综合评判与层次分析方法在复杂系统评价重要作用的基础上，引入了基于二元语义信息处理技术的复杂系统评价方法，以此三种方法为基础，加以扩展与综合，可以较好地解决多数复杂系统的评价问题。此外，文章创造性的探寻了将复杂性科学的研究热点--复杂网络理论引入到复杂系统评价问题中的初步方法，对提高复杂系统评价的科学性、准确性具有积极的意义。 最后，文章以高校科研系统评价这一具体问题，简要进行了融入复杂网络理论的基于二元语义信息处理的专家群决策的评价方法在科研复杂系统评价中的应用实践，做了具体运算，进一步明确了该方法的核心步骤，对相关领域以及复杂系统评价科学的研究具有一定的意义。