戊型肝炎病毒(HEV)实时荧光RT-PCR检测方法的建立及其初步应用

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戊型肝炎病毒(HEV)是通过粪-口途径传播的无包膜、正链RNA病毒。它能引起大规模爆发性流行,也可引起急性散发性肝炎。目前戊肝的诊断主要是通过ELISA(酶联免疫法)检测抗HEV抗体,但因为HEV感染窗口期或患者自身免疫体制以及EIA试剂本身的原因等都会给戊肝的诊断带来难度;HEV RNA检测是判断HEV病毒是否存在的标准之一,但常规RT-PCR方法操作繁琐、容易污染、敏感性低,鉴于此本课题建立了一种快速、敏感、特异性强的实时荧光RT-PCR方法来检测戊型肝炎病毒。 本研究在建立实时荧光RT-PCR方法时,首先根据ORF3保守区域(5487—5613nt)设计了26条引物和4条探针,通过对引物和探针的筛选,确定了最佳的引物(401U/402R)和探针(301F)组合,并通过对引物、探针用量的优化确定40μl体系上下游引物用量分别为4pmol和8pmol,探针用量为8pmol;其次,通过对反应体系和条件进行优化,确定了Taq酶用量为4U、AMV逆转录酶的用量为2U、逆转录温度为50℃、PCR扩增采用三步法等;最后,通过对HEV RNA抽提试剂进行比较,选择使用QIAamp Viral RNA Mini Kit抽提HEV RNA。用建立的荧光PCR方法对9个不同浓度的假病毒稀释物进行了检测,结果显示,本套试剂的检测范围为5.6×103~5.6×1010copies,最低可检测5.6×103copies的假病毒分子,标准曲线的线性相关系数也较好,其为0.9968。 用该方法对149份临床急性肝炎患者血清进行检测,结果有65例为HEV
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