水稻千粒重QTLqTGW1.2b的图位克隆

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粒重是典型的数量性状。以往研究表明,数量性状是由少数主效基因和大量微效基因共同控制的,然而,目前所开展的水稻粒重数量性状座位(Quantitative trait locus,QTL)图位克隆大多围绕主效QTL开展。鉴定控制水稻粒重的微效QTL,有助于阐明水稻粒重的遗传机理。在本实验室的前期研究中,应用籼稻品种珍汕97和密阳46衍生的6套近等基因系,在第1染色体长臂约4.5 Mb的区域内分解出了3个微效千粒重QTL:定位于933.6 kb的RM11730-RM11762区间内的qTGW1.2a,418.8 kb的RM11781-RM11800区间内的qTGW1.2b和2.1 Mb的RM11800-RM11855区间内的qTGW1.2c。本研究针对其中定位精度最高的qTGW1.2b,发展新标记,提高目标区间基因型鉴定的密度,构建分离区间更小的梯系近等基因系群体,实现了qTGW1.2b的精细定位。主要结果如下所述:根据qTGW1.2b的初步定位结果,从珍汕973/密阳46衍生的高代群体中筛选出1个在RM212-RM11787区间呈杂合的BC2F9单株;种植该剩余杂合体自交产生的BC2F10群体,利用分子标记检测基因型,筛选出分别在RM11787座位和Wn33304-RM11787区间杂合的单株各1个;种植2个单株自交后产生的2个BC2F11群体,检测基因型,从仅在RM11787座位分离的BC2F11群体中筛选母本纯合型和父本纯合型单株,自交后获得1套BC2F11:12NIL群体,称为L2,种植于生态条件差异较大的浙江杭州和海南陵水;另一方面,对在Wn33304-RM11787区间分离的BC2F11群体进行标记检测,筛选出在Wn33304-RM11787区间内呈梯形排列的5个BC2F11剩余杂合体,自交得到5个BC2F12群体,经各自目标区间内的标记检测,筛选出母本纯合型和父本纯合型单株,自交后得到在分离区间内交叠排列的5套BC2F12:13NIL群体。QTL分析结果显示,每套近等基因系均存在千粒重或粒长QTL的分离。比较5套近等基因系的分离区间,可将qTGW1.2b界定在371.5 kb的RM11781-Wn34526区间,MY46等位基因可使千粒重和粒长分别增加0.16 g和0.026mm,贡献率分别为15.41%和11.73%,qTGW1.2b通过控制粒长影响粒重。为进一步精细定位qTGW1.2b,首先利用新发展的多态性标记进一步鉴定L2重组区间的基因型组成,剔除其中的纯合区域,将qTGW1.2b界定在108.6 kb的Wn34259-RM11787区间。在此基础上,对上述BC2F11群体进行标记检测和连续自交,筛选出3个在Wn34286-RM11787区间分离且杂合区段交叠排列的BC2F13单株,自交后获得3个BC2F14群体。从3个BC2F14群体中筛选母本纯合型和父本纯合型材料,自交后获得产生3套在Wn34286-RM11787区段内交叠排列的BC2F14:15近等基因系。QTL分析结果显示,在每套群体中均存在千粒重和粒长QTL,密阳46等位基因可使千粒重增加0.120.18 g,粒长增加0.0210.037 mm。比较3套近等基因系的分离区间,最终可将qTGW1.2b界定在44.0 kb的Wn34323-Wn34367区间。该区间共包含6个开放阅读框,通过测序和表达分析,推测Os01g59410最有可能是qTGW1.2b的目标基因。
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