LncRNA TCONS00179042对PRRSV在Marc-145细胞中复制的影响

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hei4477xx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)已发现30多年,但至今没有非常有效的防控措施。2006年我国出现了PRRS高致病性毒株(Highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus,HP-PRRSV),并逐渐发展成为流行的优势毒株,对我国养猪业造成了重大的经济损失。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)存在于多种生物体内,在各类细胞中广谱表达,作为RNA调节因子在基因转录和转录后调控等多方面发挥重要作用,并通过形成免疫复合物发挥抗病毒固有免疫功能。本实验室通过前期高通量转录本测序研究发现,PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞(Porcine alveolar macrophage,PAM)后,LncRNA TCONS00179042的表达量显著低于正常PAM细胞中。因此,为了验证该LncRNA在病毒感染过程中的作用,首先采用RT-PCR克隆获得LncRNA TCONS00179042基因序列,并使用生物信息学方法进行二级结构预测分析;然后构建过表达质粒pcDNA3.1-TCONS00179042转染猴胚胎肾上皮细胞(Monkey embryonickidney epithelial cell,Marc-145),通过qPCR、Western blotting以及TCID50检测,分析该LncRNA过表达对PRRSV GSWW15病毒复制的影响;通过核质组分分离试验对PAM细胞中LncRNA TCONS00179042进行半定量分析;最后通过细胞RNA转录组测序和生物信息学预测分析方法对LncRNA TCONS00179042的靶基因进行预测。结果显示,LncRNA TCONS00179042转录本长度约为430nt,具有比较复杂的二级结构。LncRNA TCONS00179042过表达后,qPCR结果显示该LncRNA的相对表达量约是对照组的3×105倍,表明LncRNA TCONS00179042能在Marc-145细胞中过表达。利用PRRSV GSWW15株感染过表达LncRNA TCONS00179042的Marc-145细胞后,通过qPCR检测显示过表达LncRNA组PRRSV RNA拷贝数约为对照组的60%;通过Western blotting检测显示过表达LncRNA组PRRSV N蛋白表达丰度约为对照组的25%;通过病毒TCID50检测显示过表达LncRNA组PRRSV病毒滴度显著低于对照组。三组数据均显示,LncRNA TCONS00179042过表达后能显著抑制PRRSV GSWW15在Marc-145细胞中的复制,具有明显的抗病毒功能。核质分离试验结果显示细胞质和细胞核均有LncRNA TCONS00179042存在,且细胞核中的表达水平高于细胞质中。PRRSV感染过表达LncRNA TCONS00179042的Marc-145细胞后,细胞RNA转录组测序和生物信息学分析结果显示,有8个与宿主抗病毒免疫反应相关的基因上调表达,有可能是该LncRNA作用的靶基因,为进一步研究该LncRNA调控病毒复制分子机理奠定了基础。综上所述,该研究结果证明LncRNA TCONS00179042具有明显的抗PRRSV功能,其具体的抗病毒机制还需要进一步研究,为开发新的抗PRRSV策略提供了线索。
其他文献
大建中汤出自《金匮要略》,由人参(处方多用党参)、干姜、蜀椒、饴糖组成。本方虽以饴糖为君,如今药房时缺不备,多用重剂甘草,便秘者每以蜂蜜冲服代之。笔者循辨证论治原则,宗“异病
目的:探讨运用临床路径方法对术后新生儿母亲进行母乳喂养依从性健康教育的效果。方法:采用自行设计的调查表对62例术后新生儿母亲进行问卷调查。结果:术后新生儿母亲运用临床路
设施园艺技术是进行植物高效生产的一种现代农业生产方式,工厂化种植则是设施园艺的高级形式。伴随着工厂化育苗技术的发展,自动嫁接机、育苗箱、自动播种系统、环境控制系统
目的探讨血浆同型半胱氨酸(Hcy)水平与超氧化物歧化酶(SOD)浓度和阿尔茨海默病(AD)与血管性痴呆(VaD)患者认知功能损害之间的关系。方法将入组病例分成AD组和VaD组,分别测定血浆Hcy、S
<正> 研究酒的发展历史,不仅对酿酒生产技术的发展及其过程可有充分了解,而且也有助于从一个侧面来认识祖国灿烂的古老文化。本文所谈的酒,系指人工发酵的酒精产物,而不是指
<正>1农村精英在农村发展中的作用1.1农村发展的领头羊。农村精英的文化水平整体上远远高于一般村民。经济上,精英一般是本村的经济大户,较富裕的中等户。他们不仅自己富起来
近几年,博洋家纺一直在创造行业亮点与业绩惊喜,近年来在各大品牌纷纷减少线下门店的情况下,博洋家纺的线下门店却越来越多、越开越大、越开越红火,近三年实现翻番增长的目标
期刊
过去一年,虎丘区牢固树立和贯彻落实新发展理念,适应把握引领经济发展新常态,各项工作稳步开展。在关键领域奋发有为,尤其在聚力创新、聚焦富民上实现了突破、见到了成效,让
报纸
作者作为一名财务人员(会计师),多次被抽调参加有关部门组织的财务审计工作,下面结合工作实践谈一下财务收支审计常用的方法与技巧。