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猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)已发现30多年,但至今没有非常有效的防控措施。2006年我国出现了PRRS高致病性毒株(Highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus,HP-PRRSV),并逐渐发展成为流行的优势毒株,对我国养猪业造成了重大的经济损失。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)存在于多种生物体内,在各类细胞中广谱表达,作为RNA调节因子在基因转录和转录后调控等多方面发挥重要作用,并通过形成免疫复合物发挥抗病毒固有免疫功能。本实验室通过前期高通量转录本测序研究发现,PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞(Porcine alveolar macrophage,PAM)后,LncRNA TCONS00179042的表达量显著低于正常PAM细胞中。因此,为了验证该LncRNA在病毒感染过程中的作用,首先采用RT-PCR克隆获得LncRNA TCONS00179042基因序列,并使用生物信息学方法进行二级结构预测分析;然后构建过表达质粒pcDNA3.1-TCONS00179042转染猴胚胎肾上皮细胞(Monkey embryonickidney epithelial cell,Marc-145),通过qPCR、Western blotting以及TCID50检测,分析该LncRNA过表达对PRRSV GSWW15病毒复制的影响;通过核质组分分离试验对PAM细胞中LncRNA TCONS00179042进行半定量分析;最后通过细胞RNA转录组测序和生物信息学预测分析方法对LncRNA TCONS00179042的靶基因进行预测。结果显示,LncRNA TCONS00179042转录本长度约为430nt,具有比较复杂的二级结构。LncRNA TCONS00179042过表达后,qPCR结果显示该LncRNA的相对表达量约是对照组的3×105倍,表明LncRNA TCONS00179042能在Marc-145细胞中过表达。利用PRRSV GSWW15株感染过表达LncRNA TCONS00179042的Marc-145细胞后,通过qPCR检测显示过表达LncRNA组PRRSV RNA拷贝数约为对照组的60%;通过Western blotting检测显示过表达LncRNA组PRRSV N蛋白表达丰度约为对照组的25%;通过病毒TCID50检测显示过表达LncRNA组PRRSV病毒滴度显著低于对照组。三组数据均显示,LncRNA TCONS00179042过表达后能显著抑制PRRSV GSWW15在Marc-145细胞中的复制,具有明显的抗病毒功能。核质分离试验结果显示细胞质和细胞核均有LncRNA TCONS00179042存在,且细胞核中的表达水平高于细胞质中。PRRSV感染过表达LncRNA TCONS00179042的Marc-145细胞后,细胞RNA转录组测序和生物信息学分析结果显示,有8个与宿主抗病毒免疫反应相关的基因上调表达,有可能是该LncRNA作用的靶基因,为进一步研究该LncRNA调控病毒复制分子机理奠定了基础。综上所述,该研究结果证明LncRNA TCONS00179042具有明显的抗PRRSV功能,其具体的抗病毒机制还需要进一步研究,为开发新的抗PRRSV策略提供了线索。