随着我国政治经济制度改革的不断深入,适应计划经济体制的传统功能预算已不能满足公共财政改革的需求,自2000年以来,我国开始实施以部门预算为核心的预算制度改革,经过20多年的探索,部门预算改革取得了一些成效。同时,随着改革的深入也逐步涌现一些问题,如部门预算编制不科学、财政资金使用效率和效益不高、监督机制不完善、预算公开不彻底等,制约着部门预算改革的发展和深化。本文以武汉市市直部门预算编制活动为研究对象,简要介绍了部门预算的基础概念,政府预算与部门预算的关系,说明了武汉市市直部门预算资金来源的特点,介绍了部门预算的相关理论。重点分析了武汉市市直部门预算编制存对财政拨款之外的部门收支编制管理不严,预算编制时间不足,财政支出标准建设总体滞后,预算编制活动在不同主体和环节缺乏有效衔接,预算编制绩效体系不完善等问题,究其原因为部门预算编制法制化水平有待提高,部门预算机制存在缺陷,部门预算监督机制不完善。针对武汉市市直部门预算编制活动存在的问题和成因,借鉴典型市场经济发达国家部门预算编制的模式、内容、原则、程序等经验做法,通过相关理论和实践分析,提出了武汉市市直部门预算编制的改革方向,即完善预算编制内容管理和编制周期管理,改进预算编制方法,优化绩效管理体系,积极推动预算管理一体化建设,完善预算监督方式等,不断完善武汉市市直部门预算编制,提升部门预算管理水平。