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目的:筛选卵巢癌中异黏蛋白(metadherin, MTDH)基因新的变异位点,研究MTDH基因与卵巢癌临床病理学及遗传易感性的关系。方法:选取2008-2009年山东大学齐鲁医院妇产科收治的有完整年龄、月经史、生育史及家族史资料的52例卵巢癌患者血液样本作为实验组,100例同地区无肿瘤及遗传病史的健康妇女血液样本作为对照,酚-氯仿法提取外周血DNA并测其浓度、纯度后,利用聚合酶链反应(PCR)扩增和直接测序法,筛选MTDH基因新的变异位点。测序结果采用Meglign7.0和Chromas2.33软件分析。用SPSS13.0软件对所得数据进行统计学分析,以P<0.05为差异有显著性。结果:卵巢癌组52例与正常对照组100例比较,年龄分布及月经史差异无显著性(P>0.05);经过PCR扩增和直接测序并对测序结果进行分析后,卵巢癌组共发现12个变异位点,对照组共发现13个变异位点,其中共有5个为未报道过的新位点。所有变异均经二次扩增测序核实,并符合Haddy-Weinbeerg遗传平衡定律(P>0.05)。发现的5个全新SNPs (—405C>T、1G>A、2678G>T、3467C>T、3503A>T,分别命名为nsl~5)全部位于MTDH基因两侧非编码区,并且均为低频变异。另外,其他位点中有3个位于第12外显子3’UTR的SNPs (rs2438211、rs2449512、rs1311),分析显示它们处于完全连锁不平衡状态,在我们研究人群中只检测到2个单倍型C2928A3088T3540(野生型)、C2928G3088T3540(突变型),3个基因型C/C2928A/A3088T/T3540(野生型),C/T2928A/G3088T/C3540(杂合型)和T/T2928G/G3088C/C3540(突变型)。对卵巢癌组与正常对照组中都存在的变异位点的基因型及等位基因频率分布进行行×列表的x2检验,结果显示无统计学差异(P>0.05),提示均与卵巢癌遗传易感性无显著关联。但是,以手术病理分期对52例卵巢癌样本中拥有完整手术记录的32例样本的基因型及等位基因频率分布进行分析,发现1681G>A,2928C>T,3088A>G,3540T>C 4个位点的等位基因频率在早期癌与晚期癌之间的分布有显著差异(P<0.05)结论:在MTDH基因中共筛选出5个全新变异位点;分析所有变异位点发现MTDH基因单核苷酸多态性与卵巢癌的遗传易感性未见相关性;已知位点中有4个位点的等位基因频率分布与卵巢癌手术病理分期相关。