玉米是我国重要的作物之一,在我国农业生产中占有重要的地位。种质资源的遗传多样性评价以及种质间的遗传关系研究是玉米育种研究的主要内容。但是,由于选用亲本遗传多样性下降导致的遗传基础狭窄问题,是育种难以取得突破性进展的重要原因。本实验利用SSR自动荧光检测技术,分析了我国核心玉米自交系的遗传多样性水平和群体遗传结构,主要的研究结果如下:1.利用覆盖玉米全基因组的84个SSR标记位点对136份自交系进行了遗传多样性分析,共检测到756个等位变异,平均每个SSR位点为9个等位变异,基因多样性平均为0.7066,多态性信息含量(PIC)平均为0.6682。表现出了较高的遗传多样性。2.在84个SSR位点中,二核苷酸重复类型SSR位点在等位变异的检测效率上明显高于多核苷酸重复类型的SSR位点,同样在遗传多样性的检测效率上也明显高于多核苷酸重复类型的SSR位点。3.对136份自交系根据Euclidean算法的聚类结果表明:研究材料可以划为四大类群,包括Reid、P群、Lancaster群和国内混合群。在国内混合群中又可以划五个分支。4.群体结构分析表明,以遗传相似性比例=80%为划分标准,研究材料可划分为四大来源,且分别对应于我国玉米自交系的四大杂种优势群:Reid、P群、塘四平头和Lancaster群,各亚群在所有材料中所占的比例分别为12.50%、16.17%、11.03%和34.56%。另外,还有35份自交系与任何亚群的遗传相似性比例均＜80%,将这些材料划分为一个混合亚群,占到总材料的25.74%。5.本实验采用了基于遗传距离和基于模型的两种方法,对136份自交系进行了群体结构研究,比较两种方法所得的结果基本一致。