我国的农产品物流起步较晚，与世界发达国家相比还存在较大差距，这严重阻碍了农产品的流通。从2009年开始的农超对接试点工作开始，农产品以另外一种流通模式出现在消费者面前，其易腐易损的特点也使传统的常温物流慢慢被冷链物流取代。经过近几年的发展，农超对接模式下农产品冷链物流有了一定的发展，但在发展过程中也暴露出一些问题（如冷链物流环节繁多、企业成本管理混乱、产品冷藏技术和设备落后等），导致农产品价格高居不下，严重影响了农民、消费者及企业等各方面的利益，农产品的流通也受到了较大的阻碍。为了提高农民的收入，使农产品能够高质量、好效率的流通，提高企业的市场竞争力，对农产品冷链物流成本管理进行优化显得尤为重要。本文首先介绍了课题研究的背景、目的和现实意义，总结了国内外学者的研究现状。论述了农产品冷链物流的相关概念，从农超对接到冷链物流，再到冷链物流成本，且详细分析了农产品冷链物流的成本构成等问题，为下文的分析研究奠定了理论基础。其次，本文分析了我国农超对接模式下农产品冷链物流成本的管理现状，以及在成本管理中存在的主要问题。结合存在的问题，接下来运用层次分析法（AHP），分析了在农产品冷链物流活动中对成本影响较大的因素，针对企业在物流成本核算中存在的问题，基于作业成本法对农产品冷链物流成本核算进行优化分析，结合具体的实证研究，提出企业成本优化的策略。进行了成本优化对农超对接模式的适用性分析，同时借鉴发达国家的成功经验，结合我国的基本国情，提出冷链物流成本的优化途径。本研究得到了国家自然科学基金项目（51108040）的资助。