miR-196a2单核苷酸多态性与白癜风易感性的关联及机制研究

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白癜风是皮肤科常见的获得性色素脱失性疾病,以皮损部位黑素细胞明显减少或消失为特征。黑素细胞破坏或凋亡的机理迄今尚未完全阐明,白癜风的发病机制的研究多集中在自身免疫、神经因子、氧化应激、代谢毒素、遗传等学说。越来越多的学者认为,白癜风的发生和进展是多因素多基因共同作用的,其中基因遗传变异决定个体罹患白癜风的易感性。另外越来越多的研究显示白癜风发病与氧化应激密切相关,白癜风患者皮损区出现过量H2O2的蓄积。microRNA(miRNA)是约22个核苷酸长度的非编码小分子RNA,从具有一个或多个发夹样结构的前体pre-miRNA加工而来。miRNA通过与靶信使RNA(mRNA)的3’非翻译区(3’-UTR)结合对转录后水平发挥负调节作用,使mRNA翻译抑制或降解,在机体的多种生理和病理过程中有重要作用。有研究显示人类大约60%编码蛋白基因受到miRNA的调控。单核苷酸多态性(SNP)是人类基因中最常见的基因变异,可影响基因的表达、转录、翻译、修饰,是疾病易感性和导致药物反应性个体和种族差异的重要原因之一。研究表明miRNA的SNP与多种人类疾病相关,可以影响疾病的表型或发生发展,目前肿瘤性疾病如肺癌、乳腺癌、肝癌等研究较多,在一些非肿瘤性疾病如小儿先心病、煤工尘肺等中也有研究。明确位于miRNA的SNP是否与白癜风的易感性有关联,寻找到与白癜风发生发展可能相关的miRNA,初步探讨其SNP对黑素细胞功能有无影响,可能对白癜风的发生机制及临床治疗提供新的理论依据。方法:通过公共miRBase数据库和文献查找所有miRNA,筛检并确认pre-miRNA中MAF>5%的SNP位点及在中国人群中的分布情况。应用分子流行病学病例-对照的研究方法,PCR-RFLP的实验方法,探讨miRNA的SNP与白癜风易感性的关联性。筛选出与白癜风易感性相关miRNA分子,并构建不同基因型miRNA分子的真核表达质粒,瞬时转染黑素细胞PIG1,通过检测黑素细胞活力、凋亡和超微结构变化,观察miRNA单核苷酸多态性对H2O2诱导氧化应激下黑素细胞生物学的影响。之后对筛检出的相关miRNA应用生物学预测软件进行靶基因的预测,并通过双荧光素酶报告基因实验验证miRNA和预测靶基因之间的关系。检测转染不同质粒组黑素细胞中黑素合成量和酪氨酸酶活性,以及H2O2处理黑素细胞后各组ROS水平的变化,通过以上功能学实验进一步验证miRNA单核苷酸多态性对靶基因的调控以及黑素细胞损伤的影响。结果:1.从400个已知的人类pre-miRNA中确定了课题组研究的4个miRNA的SNP位点:miR-146a rs2910164,miR-149rs2292832,miR-196a2rs11614913,miR-499rs3746444,在819例白癜风病例组及817例对照组中鉴定出4个研究位点的基因型,通过统计学分析发现,具有miR-196a2CC基因型的个体与TT和TC的联合基因型相比白癜风的易感性降低。在其它3个miRNA鉴定的基因型分析结果中没有显示出类似的主效应。.对miR-196a2rs11614913CC基因型与TT和TC联合基因型进行了分层分析。观察到白癜风易感性的降低主要表现在以下组别中:年龄大于20岁,女性,散发型白癜风,无白癜风家族史,不伴有其它自身免疫性疾病,病史超过1年的患者。2.成功构建了miR-196a2的表达质粒pCDNA3.1-miR-196a2-T和pCDNA3.1-miR-196a2-C。H2O2诱导的氧化应激下,CCK-8结果显示转染pCDNA3.1-miR-196a2-T和pCDNA3.1-miR-196a2-C表达质粒组黑素细胞的活力无显著性差异。流式细胞术结果显示,转染pCDNA3.1-miR-196a2-T和pCDNA3.1-miR-196a2-C表达质粒组的黑素细胞早期凋亡率均有显著降低(P<0.05),并且pCDNA3.1-miR-196a2-C和pCDNA3.1-miR-196a2-T相比凋亡也显著减少(P <0.05)。透射电镜下观察细胞超微结构发现,转染对照组细胞显示明显的凋亡改变,转染pCDNA3.1-miR-196a2-T表达质粒组细胞有轻微的凋亡变化,而转染pCDNA3.1-miR-196a2-C表达质粒组无明显的凋亡改变。3.通过生物信息学软件预测出可能与白癜风氧化应激相关的miR-196a2靶基因TRP-1,将其作为miRNA-196a2SNP研究的靶基因。成功构建了TRP-1的报告基因质粒psiCHECK2-TRP-1。双荧光素酶报告系统结果显示,miR-196a2-T和miR-196a2-C均结合靶基因TRP-1,从而抑制荧光素酶的表达,并且miR-196a2-C比miR-196a2-T更加容易和靶基因相结合(P <0.05)。与转染对照组pCDNA3.1质粒黑素细胞相比,pCDNA3.1-miR-196a2-C质粒组黑素合成量显著降低(P<0.01)。H2O2处理后与转染对照组质粒黑素细胞相比,转染pCDNA3.1-miR-196a2-C表达质粒组黑素细胞中ROS水平显著降低(P <0.05)。结论:1.具有miR-196a2CC基因型的个体与TT和TC的联合基因型相比白癜风的发病易感性降低,miR-196a2SNP rs11614913T>C可能降低白癜风易感性。2. H2O2诱导的氧化应激下,miR-196a2SNP rs11614913T>C可减少黑素细胞的早期凋亡率,对黑素细胞凋亡具有保护作用。3. TRP-1是miR-196a2的靶基因,并且miR-196a2-C比miR-196a2-T更加容易和它相结合。miR-196a2SNP rs11614913T>C可能通过结合靶基因TRP-1而降低H2O2处理后的ROS水平,从而保护黑素细胞的损伤。
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