在植物整个生命周期里，干细胞持续地产生各种子代细胞以维持组织的生长、更新与修复。植物由于固着生长，于是无法逃避能够引起DNA损伤的不利环境条件。因此，干细胞必须具有高效的DNA损伤反应，以防止突变传播给更大范围的植物体内。全今，人们对于基因组稳定性与干细胞微环境维持之间的分子联系仍知之甚少。本论文以拟南芥根尖为模式结构，发现SUMOE3连接酶AtMMS21调控根尖干细胞微环境的维持，而且这个过程与DNA损伤反应有关。　　突变AtMMS21导致根尖分生组织的细胞分裂和细胞分化模式发生改变，说明AtMMS21是根尖分生组织的结构与功能维持正常所必需的。通过检测QC特异性marker的表达和根尖干细胞的命运，发现MMS21功能缺失引起了缺陷的QC特化以及失常的干细胞。由于拟南芥根尖干细胞微环境是由QC及其周围的干细胞组成的，所以mms21-1突变体显示出结构混乱的根尖干细胞微环境。此外，mms21-1胚胎中胚根原的后代细胞出现异常分裂，导致根尖干细胞微环境起始的位置--胚胎基极，发生结构错乱。因此，无论是胚胎发育时期还是胚后生长时期，AtMMS21在干细胞微环境的维持中都起到着关键的作用。　　根尖干细胞微环境由多能转录因子所调控，而基因表达分析发现：在mms21-1根尖，SHR和SCR的正常空间表达模式出现部分缺失进而呈现不连续的表达模式；WOX5和SCR发生异位表达从而呈现相邻细胞也表达GFP的模式；PLT1和PLT2在蛋白水平发生严重下调进而呈现表达/积累减少的模式。这些结果表明，AtMMS21是调节多能性转录因子在根尖干细胞微环境中稳定表达所必需的。　　此外，mms21-1根的生长对DNA损伤剂超敏感，而且突变体根尖展示持续激活的DNA损伤反应。相应地，mms21-1根尖干细胞微环境出现自发的细胞死亡，进而导致干细胞微环境的结构紊乱。这说明，AtMMS21通过保护干细胞群体的基因组稳定性，以使根尖干细胞微环境保持正常的结构与功能。至少部分地，AtMMS21通过防止DNA损伤的加剧从而维持干细胞的存活。　　蛋白互作分析显示，AtMMS21与AtSMC5在酵母和植物体内都相互作用，表明AtMMS21是SMC5/6复合体的一个亚基。而该复合体是高度进化保守的染色体ATP酶，在细胞生长和DNA修复中具有重要的作用。而且，mms21-1和smc5-2突变体在胚胎发育以及DNA修复方面存在表型重叠，说明AtMMS21与AtSMC5存在功能重叠，它们可能相互作用共同维持基因组的稳定性以及干细胞微环境的特化。　　总之，本研究首次揭示了AtMMS21介导的SUMO化修饰在根尖干细胞微环境和植物基因组稳定性的维持中起到关键的作用，并从两方面解析其可能的分子机制。一方面，AtMMS21作为一个SUMOE3连接酶，通过控制多能性转录因子在根尖干细胞微环境中稳定地表达，从而维持根尖干细胞微环境；另一方面，AtMMS21作为SMC5/6复合体的一个亚基，通过抑制DNA损伤诱导的根尖干细胞死亡，从而维持根尖干细胞微环境的正常结构与功能。由此可见，AtMMS21在维持干细胞微环境和基因组稳定性之间提供一个新的分子联系。