【摘 要】
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目的:通过数据库筛选出在急性髓系白血病（Acute Myeloid Leukemia,AML）中的差异表达基因,研究差异基因在HUVEC、K562和MV4-11细胞株和AML患者的表达水平及其意义,并利用数据库初步探讨差异基因与AML预后的关系。方法:1.我们从GEO数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）选取了三个关于AML的数据集GSE90062,GSE37307和GS
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目的:通过数据库筛选出在急性髓系白血病（Acute Myeloid Leukemia,AML）中的差异表达基因,研究差异基因在HUVEC、K562和MV4-11细胞株和AML患者的表达水平及其意义,并利用数据库初步探讨差异基因与AML预后的关系。方法:1.我们从GEO数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）选取了三个关于AML的数据集GSE90062,GSE37307和GSE114868,以三个数据集筛选高表达基因进行取交集,得到差异基因。2.利用富集和通路,蛋白互作网络等讨论差异基因与AML的关系。3.利用q RT-PCR技术检测25例确诊新发的AML患者以及15例正常对照组的差异基因表达水平。应用Spearman相关分析法分析差异基因的表达水平与AML患者临床病理参数的关系。4.通过q RT-PCR技术检测差异基因在K562和MV4-11细胞株中表达水平。5.在GTEx数据库（Genotype-Tissue Expression,GTEx）和TCGA数据库（The Cancer Genome Atlas,TCGA）分别得到健康人和肿瘤患者的差异基因的表达量,验证差异基因的表达水平。在数据库中进行单因素和多因素统计分析方法分析差异基因对AML患者的预后影响,用R语言建立AML患者的列线图（Nomogram）模型进行生存率的预测。结果:1.从数据库筛选出ANGPT1、DUSP10、SSBP2和DNM1基因。2.富集分析差异基因的功能,ANGPT1参与细胞凋亡、蛋白质运输、能量代谢和多种信号通路。DUSP10涉及细胞代谢和信号转导。SSBP2涉及能量代谢。DNM1参与细胞结构、信号转导和能量代谢等。蛋白互作网络四个基因之间没有共表达关系。3.新发AML患者的DUSP10、SSBP2和DNM1的表达水平与对照组中的表达水平之间差异有统计学意义（P0.05）。Spearman相关分析中,SSBP2与外周血初始白细胞计数和血红蛋白呈负相关（r=-0.458,P=0.028;r=-0.422,P=0.045）。DNM1和血红蛋白呈负相关（r=-0.469,P=0.018）。4.与对照组HUVEC细胞相比,K562细胞中ANGPT1、SSBP2和DNM1高表达,差异均有统计学差异（P<0.05）。与对照组HUVEC细胞相比,在MV4-11细胞中ANGPT1和DUSP10低表达,差异有统计学差异（P0.05）。5.在TCGA联合GTEx验证了差异基因的表达。数据库中生存分析显示SSBP2和DNM1可能对AML的预后产生影响（P<0.05）。在列线图模型中,所得到分数越高的AML病人的生存率越高,从而可以推测AML病人的生存率。结论:1.从数据库中筛选了可作为AML差异基因的是ANGPT1、DUSP10、SSBP2和DNM1。2.与对照组相比,DUSP10、SSBP2和DNM1在AML患者中表达增高,可能与AML的发生有关。3.与对照组细胞株相比,ANGPT1和DUSP10在MV4-11细胞株中显著低表达,SSBP2和DNM1的表达水平在MV4-11细胞株中无明显差异,需进一步实验进行探究其机制。4.在TCGA数据库中,SSBP2和DNM1呈高表达水平的患者有着更好的总体生存率,SSBP2和DNM1的表达水平可能与AML患者预后有关。
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