大连地区不同分泌型母乳菌群的差异研究

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健康肠道菌群的建立对新生儿的生长发育至关重要。母乳喂养是塑造新生儿早期肠道菌群结构的主要因素之一。母乳含有多种生物活性物质,包括母乳低聚糖(HMOs)和微生物,对婴儿肠道菌群丰富性以及多样性的构建起到重要作用。研究显示母亲乳腺携带岩藻糖基转移酶2(FUT2)基因的类型(分泌型和非分泌型)不同,其在哺乳期所分泌母乳中的HMO成份变化也有所不同,进而影响子代肠道菌群的发展。但是FUT2基因型的不同对母乳菌群的影响尚不清楚。目的:探讨辽宁大连地区分泌型和非分泌型母亲哺乳期间母乳菌群的主要差异。方法:于大连市妇产医院纳入42位志愿者产妇,收集其产后第6天的母乳样本。提取母乳样本DNA,并对包含rs601338和rs1047781单核酸位点多态性(SNP)的片段进行聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)并测序以检测受试母亲岩藻糖基转移酶2(FUT2)基因类型。采用16S r DNA高通量测序法对不同母乳样本中微生物的多样性进行分析,并且对不同母乳样本中的微生物丰度及类型展开探讨。结果:1.通过FUT2基因SNP判别受试母亲的分泌类型通过PCR方法分别对42个志愿者母亲FUT2基因中的rs601338和rs1047781片段进行扩增,并进行测序,比对得出SNPs位点。FUT2基因中rs1047781的A/T突变情况与母亲的分泌型分型结果相吻合,即在FUT2基因组中,非分泌型母亲个体的A突变为T,未突变的则为分泌型。42位志愿者中,36位母亲是分泌型,6位母亲是非分泌型。2.分泌型和非分泌型母亲母乳菌群差异分析分泌型与非分泌型两组母亲母乳菌群比较,Shannon,ACE和Chao1等反映组内差异的α多样性指数在两组间没有显著性差异。通过使用主坐标分析,发现分泌型组和非分泌型组的距离相对较远,母乳菌群组内菌群结构相似,组间差异性较大。根据OTU分类结果,得到不同分类层次上各组的具体组成。发现分泌型和非分泌型两组母乳菌群相对丰度具有一定差异。如从门水平分析,与非分泌组相比,分泌组变形菌门Proteobacteria的相对丰度增加,厚壁菌门Firmicutes和放线菌门Actinobacteria的相对丰度降低。3.分泌型和非分泌型母亲母乳菌群中的特征性微生物对两组样本16S r RNA数据进行STAMP分析,在科水平上,母乳中的主要微生物菌群为Family Xi及Methylobacteriaceae。其中分泌型母亲母乳菌群Family Xi家族的物种的相对丰度远高于非分泌组(p<0.05)。在属水平上,母乳主要菌属为Gemelia及Methylobacterium。其中分泌型母亲母乳菌群Gemelia家族的微生物的相对丰度远高于非分泌组(p<0.05)。在种水平上,母乳中的主要菌种为Acinetobacter pittii及Methylobacterium komagatae。其中分泌型母亲母乳中Acinetobacter pittii的相对丰度远高于非分泌组(p<0.05)。结论:母乳菌群构成在一定程度上受到母体岩藻糖基转移酶2(FUT2)基因类型,即母亲分泌型和非分泌型的影响。
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