21世纪初，随着中国高等教育国际化与市场化的发展，高校传统的竞争模式要作战略性调整：由竞争转向合作、由双边合作转向多边合作。在这种背景下，高校联盟日益成为高校应对外部环境压力的一种有力手段。高校联盟是三所或三所以上有着共同利益追求的高校，在高校内外部力量的作用下所形成的、受一定的共同规则所约束且各校保持独立身份的多边合作组织。本论文以中国高校联盟的运行机制为主要研究对象，通过多案例分析对我国高校联盟进行系统的研究，力图回答以下几个问题：①中国高校联盟为什么会产生？②中国高校联盟有哪些主要模式？③不同模式的高校联盟如何运行？　　 科学的分类有利于对事物的深入研究。本文以理性选择制度主义为理论基础，以行动者与行动情景为分类维度，将中国高校联盟分为区域同质高校联盟、全国同质高校联盟、全国异质高校联盟和区域异质高校联盟四种类型，并根据政府权力、市场力量以及专业权力在联盟形成中所起的协调作用对联盟分类进行了学理探析。本研究选择其中的三类联盟进行了深入调查，对每个案例进行深度描述：成立背景、联盟动机、发展历史、组织机构、开展活动、联盟绩效以及联盟运行存在的问题等。在此基础上，对每种模式的动力机制、联盟内部运行机制以及联盟与外部环境的互动三方面进行了讨论与分析。在区域同质型联盟中，地方政府始终发挥着至关重要的作用，联盟的运行很大程度上体现地方政府的意志，联盟是高等教育区域化发展的结果，也是地方政府对地方高校分类管理的需要；全国同质型联盟是市场力量作用下高校的自主行为，联盟从最初重视学科建设向重视人才培养转变，联盟在与政府互动时具有利益集团的性质；区域异质型联盟是在一个不断变化的动力体系推动下形成与发展的，联盟由于推动联盟运行的核心动力的动态性而具有不稳定性，其内部组织间关系具有资源交换的特征，政府对该类联盟的干预也逐渐减弱。　　 通过对三种联盟模式的多案例研究，本研究归纳出中国高校联盟的共同特质：①高校联盟的成员具有自主性，其开展的活动以交换为特征，成员高校间具有依赖性等三个基本特征；②高校联盟具有三项基本功能，即资源共享的交换器、调整关系的缓冲器与提供信息的服务器；③中国高校联盟分为区域同质高校联盟、全国同质高校联盟、全国异质高校联盟和区域异质高校联盟四种类型；④高校联盟运行机制是：利益需求是高校联盟的原动力；联盟的组织设计一般呈简单结构型；联盟的内部运作具有资源交换的特征；联盟与政府是一种互动共生的关系。　　 中国高校联盟是一个正在成长的新兴事物，许多因素制约着联盟的良性运转。首先，就中国高校联盟而言，简单模式的组织结构不利于发挥成员高校的积极性，导致联盟内部横向沟通不足，成员高校合作意识较差。虽然高校联盟建立了一定的沟通机制，但成员高校的沟通在互动性、沟通渠道以及信息交流等方面还是存在许多障碍。其次，由于成员彼此之间信任的缺乏，高校联盟内部的合作关系常常会面临不确定性，而这种不确定性往往会影响联盟的健康发展。再次，合理的利益分配机制是联盟正常运行的前提，是合作高校为追求联盟利益的可靠保证，然而，中国高校联盟当前的利益分配机制尚不够健全，还不能够充分发挥高校的整合力量、激发联盟成员的活力、维护联盟稳定的作用。最后，政府的干预可给高校联盟带来积极或消极的后果，我国政府对高校联盟存在过度干预或干预不足两方面的问题，尚未充分发挥政府的宏观引导作用。总之，过于简单的组织结构、欠完善的内部协调机制、缺位的利益分配机制的以及不当的政府干预影响联盟的良性运转。针对中国高校联盟运行机制所存在的问题，笔者提出了相应的对策建议：采用矩阵模式的组织设计、完善沟通机制与信任机制、建立以成员高校贡献多少为前提的利益分配机制以及政府要适度参与高校联盟的建设。