本研究在湖南省猪鞭虫感染情况调查的基础上,对猪鞭虫线粒体cox1基因序列和核糖体ITS基因序列进行分析,为湖南省猪鞭虫病的防治提供科学依据。第一部分对湖南省七个地区的猪鞭虫感染情况进行调查。结果显示,总感染率为8.91%,平均感染强度EPG值为1775。不同地区的猪鞭虫感染率差异较大,散户场猪鞭虫感染率明显高于规模化场。不同年龄段的猪以4-6月龄的感染率最高。第二部分对湖南省不同地区的7株猪鞭虫进行cox1基因进行序列分析与鉴定。测序结果cox1基因序列片段长度为416-418bp,序列分析猪鞭虫分离株线粒体cox1基因序列的种内差异为0.0-2.3%,主要是以碱基互换和碱基丢失为主,与Genbank基因库中收录的猪鞭虫相似性为97.1%-98.3%,与人鞭虫的相似性相对较低,为73.1%-74.6%,种间差异明显。A、T、C、G四种碱基含量分别为28.30%-29.19%、36.26%-37.35%、15.55%-16.31%、18.13-18.31%。猪鞭虫线粒体cox1基因种内差异明显小于种间差异,cox1基因可以作为种间遗传标记应用于猪鞭虫的分子鉴定、种系发育研究等遗传学研究。第三部分对湖南省不同地区的7株猪鞭虫进行ITS基因进行克隆与序列分析。测序结果ITS基因序列片段长度为1443-1447bp,序列分析猪鞭虫分离株核糖体ITS基因序列的种内差异为0.3%-3.7%,主要是以碱基互换和碱基丢失为主,与Genbank基因库中收录的猪鞭虫相似性为97.5%-98.1%,与人鞭虫的相似性相对较低,为67.7%-71.7%,种间差异明显。碱基含量A+T为38.62%-38.93%,C+G为61.07%-61.38%。猪鞭虫核糖体ITS基因种内差异明显低于其种间差异,核糖体ITS基因可以作为遗传分子标记应用于猪鞭虫的分子鉴定与种系发育等遗传学研究。本研究在我国系首次对湖南省猪鞭虫的感染情况进行全面而系统的调查,对湖南省猪鞭虫进行分子生物学研究,为该线虫的分类、鉴定、诊断、分子流行病学、群体遗传学以及系统发生学等诸多方面的研究奠定基础。