益智(Alpinia oxyphylla Miquel)是姜科(Zingiberaceae)山姜属多年生草本植物，是我国传统中药材，为中国特有。　　 为了更好地研究益智的遗传多样性和居群结构，保护有限的益智资源，我们用SSR法对益智遗传多样性和遗传结构进行更全面的研究。主要结果如下:　　 1、本研究开发出益智81个微卫星位点，筛选出23对具有多态性的微卫星引物，以应用于益智及其近缘属（种）的遗传学和分子系统学研究。　　 2、选取10对引物对益智的14个野生居群和5个栽培居群共431个个体进行遗传多样性研究。结果表明，益智居群期望杂合度He的平均为0.707，Shannon多样性信息指数Ⅰ平均为1.59，遗传多样性略高于平均水平。益智总的遗传分化系数Fst为0.155，居群内的遗传分化大于居群间的遗传分化。居群间平均基因流Nm大于1，表明益智居群间不存在基因交流障碍。益智的平均近交系数为0.079，表明益智具有一定程度的近交。　　 3、19个居群亲缘关系分析表明，广东省野生居群与海南省野生居群的亲缘关系较远。栽培居群主要引种于附近的野生居群，华南植物园益智主要引种于海南。