sRNA是细菌重要的转录后调控因子,调控细菌生长代谢及毒力等各方面的功能。大多数反式转录型sRNA通过与靶基因mRNA的不完全互补配对影响靶基因mRNA的稳定性或/及翻译起始。这种独特的调控方式使sRNA能与若干mRNA存在完全或不完全的互补配对区,但这些mRNA的表达并不一定都受其调控,这给寻找sRNA调控的直接靶标带来了难度,致使大多数sRNA的调控靶标未知。因此,寻找sRNA识别的靶基因mRNA序列的保守性及标志信号具有重要意义。本研究从寻找未知功能sRNA SraG的调控靶标及sRNA调控靶基因序列的标志性信号对sRNA的调控机制进行了探索。论文主要包括以下三方面的工作:　　 一、假结核耶尔森氏菌SraG调控的靶基因筛选鉴定　　 sRNA SraG存在于多种细菌,但调控功能未知。SraG在假结核耶尔森氏菌YpⅢ各个生长时期的转录水平保持一致。比较蛋白组学发现sraG缺失后16个蛋白表达水平发生1.5倍以上改变,其中pnp与YPK＿1205的mRNA水平受到sraG缺失的影响。YPK＿1205与YPK＿1206位于同一操纵子内,SraG在转录后水平调控该操纵子的表达,YPK＿1206的编码区(+30-+38)对于SraG调控其表达是必须的。YPK＿1206及YPK＿1205的蛋白水平与mRNA水平均在sraG hfq的双突变体中出现累积效应,表明SraG对YPK＿1206-1205操纵子的调控并不需要Hfq的辅助。　　 二、靶基因序列中保守的腺嘌呤信号对sRNA调控靶基因的影响　　 对5’末端互补配对型sRNA识别的靶基因序列进行分析,发现其所调控的靶基因在与sRNA互补配对区之后紧跟一个腺嘌呤(A)信号,极少数情况下为一个鸟嘌呤(G)信号。以Salmonella RybB-ompF为模型,分析3’A信号是否参与sRNA的调控。无论是异源表达RybB还是由外膜压力激活RybB表达,发现A信号突变为胞嘧啶(C)或尿嘧啶(U)后,RybB引起的ompF mRNA降解减缓;但突变为G信号后,ompF mRNA降解与野生型一致,表明3’A信号参与RybB对靶基因ompF的调控。同样发现3’A信号参与RybB(M2)对ompN(M2)及MicC对ompC的调控,说明3’A信号参与sRNA调控具有普遍性,该结果可以为预测5’末端配对型sRNA靶基因提供帮助。　　 三、参与腺嘌呤信号调控的组分鉴定　　 在Salmonella Rnase E的C端截短突变体中,RNA降解复合体不能合成。对该突变体3’A信号效应的检测发现3’A信号突变为C或U后,RybB引起的ompF降解速率与野生型靶基因mRNA相同,说明RNA降解复合体参与3’A信号的调控。当RhlB缺失且ompF的A信号突变为C后,由RybB引起的ompFmRNA降解速率与野生型一致,但PNPase的缺失并不能取消由于A信号的突变所带来的效应,说明RhlB是3’A信号参与sRNA调控必须的,并非由于PNPase的作用。同时还检测到在△rhlB中,sRNA引起的靶基因mRNA的降解相对于野生型减慢,并且降解中间产物信号增强。综合这些结果,提出了3’A信号参与sRNA调控的模型。