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牡丹（Paeonia suffruticosa）是重要的观赏植物,因其雍容华贵、富丽端庄的姿态深受人们的喜爱。牡丹花期短而且集中,大大制约了牡丹的园林应用,如何延长牡丹花期是牡丹研究者一直致力的问题。现有的栽培牡丹品种花枝类型多为一枝一花（单花）,但少数牡丹品种花枝类型为一枝多花,有侧花/侧蕾发生,且顶花、侧花的花期不同步,顶花先开放,侧花后开放,顶、侧花的陆续开放增加了花量,延长了花期。本文以单花品种‘梨花粉’及有侧花品种‘姊妹游春’、‘云鄂粉’为研究对象,结合花芽分化形态学观察、分化过程中生理生化物质测定,初步掌握两类品种花芽分化过程各阶段特征的异同、分化过程中生理生化物质的变化规律,结合‘姊妹游春’侧花原基分化阶段转录组分析,并进行功能富集分析,筛选与碳水化合物及激素、分枝相关的差异表达基因,结果如下:1)单花品种‘梨花粉’花芽分化可分为6个时期:叶原基分化期（LP）、苞片原基分化期（BP）、萼片原基分化期（Se P）、花瓣原基分化期（Pe P）、雄蕊原基分化期（SP）、雌蕊原基分化期（PP）。‘姊妹游春’等有侧花牡丹品种花芽分化可分为11个时期:叶原基分化期（LP）、顶花苞片原基分化期（TBP）、顶花萼片原基分化期（TSe P）、顶花花瓣原基分化期（TPe P）、顶花雄蕊原基分化期（TSP）、顶花雌蕊原基分化期（TPP）、侧花苞片原基分化期（LBP）、侧花萼片原基分化期（LSe P）、侧花花瓣原基分化期（LPe P）、侧花雄蕊原基分化期（LSP）、侧花雌蕊原基分化期（LPP）,顶、侧花原基分化起始时间有差异,顶花原基先分化,侧花原基后分化,与顶花相比,侧花苞片原基分化时间大大延长,‘姊妹游春’侧花苞片原基分化较顶花苞片原基分化延长31d,‘云鄂粉’延长22d,侧花苞片原基分化与顶花花瓣、雄蕊、雌蕊原基分化同步,顶花原基分化基本完成后,侧花迅速完成萼片、雄蕊、雌蕊原基的分化,与单花牡丹品种相比,有侧花牡丹品种增加了至少一个侧花,花芽分化历时更长。2)有侧花品种‘姊妹游春’、单花品种‘梨花粉’花芽分化过程叶片中可溶性糖含量均呈降低-升高趋势,无论是单花还是有侧花品种,在花芽分化前可溶性糖均有所积累,随着花芽分化的开始逐渐降低,可溶性糖的积累可能对牡丹花芽分化起促进作用。‘姊妹游春’叶片可溶性淀粉含量呈升高-降低趋势,‘梨花粉’则一直处于降低趋势,花芽分化起始阶段,‘姊妹游春’可溶性淀粉含量升高,‘梨花粉’则有所降低,淀粉可能是花芽分化过程中的能源补充物质。‘姊妹游春’侧花原基分化阶段,可溶性糖及淀粉含量均降低。‘姊妹游春’花芽分化过程中叶片可溶性蛋白含量总体呈升高-降低-升高-降低趋势,‘梨花粉’总体呈升高-降低趋势,‘梨花粉’雌雄蕊原基分化时期,可溶性蛋白降幅明显,雌雄蕊的形态建成可能需要更多的蛋白质。3)激素对花芽分化起重要的调控作用,较高含量的ABA、GA3、ZRs以及较低含量的IAA可能对单花品种‘梨花粉’及有侧花品种‘姊妹游春’花芽分化的启动起促进作用,较高含量的ZRs、IAA以及较低含量的ABA、GA3可能有利于有侧花品种‘姊妹游春’侧花原基分化的启动。4)通过侧花分化阶段转录组比较分析筛选差异表达基因,‘姊妹游春’侧花分化起始阶段共有23988个差异基因表达,其中上调基因13519个,下调基因10469个,淀粉合成相关基因SS4、GBSS1及淀粉代谢相关基因AMY、BAM均上调表达。与激素有关差异基因有491个,上调基因247个,下调基因244个,其中,IAA合成相关基因ILR1、YUC及转运相关基因ABP,CTKs响应因子ARR9,ABA合成相关基因DCED1及ABA代谢相关基因PYL4、ABAH、PYR1以及赤霉素氧化基因GA3OX2、GA3OX3、GA3OX4以及赤霉素合成相关基因CPS均发生差异表达。许多与分枝相关基因发生差异表达,如转录因子CUC1、BRC1、LOF1,与生长素相关基因AXR1、YUCCA以及作用于侧生分生组织起始阶段的LAS基因,调控侧芽生长的MAX1、MAX2、RMS4等基因,这些基因可能与牡丹侧花芽/侧花枝的形成有较大相关性。